More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0583 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 308 aa  610  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  56.86 
 
 		 307 aa  362  6e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  37.27 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1616  MscS Mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 312 aa  95.9  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0843  MscS mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 		 324 aa  95.5  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0543  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.979226  hitchhiker  0.000989319 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1431  MscS mechanosensitive ion channel  35.52 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.23778  normal  0.0751617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  24.9 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.89 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  26.41 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  26.41 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  32.39 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0426  MscS mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000444789  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5651  hypothetical protein  26.58 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  32.11 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  23.79 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  24.88 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65040  hypothetical protein  26.16 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0222155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  25.42 
 
 		 429 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  26.73 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  24.76 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  27.56 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  24.6 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  22.32 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  29.29 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  26.06 
 
 		 794 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  24.78 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  26.61 
 
 		 531 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  21.46 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0246  hypothetical protein  30.29 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1616  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.19083  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00678  mechanosensitive ion channel family protein  24.88 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.096226  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4751  mechanosensitive ion channel protein  27.78 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 551 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 551 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  25.82 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 540 aa  62.4  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  23.81 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 550 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  24.1 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 384 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  23.11 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  28.42 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  28.57 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 544 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4037  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  25.71 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1557  mechanosensitive ion channel family protein  25.53 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  27.78 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  31.36 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.66 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.05 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  24.75 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2483  MscS mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.750322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>