216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5057 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  100 
 
 		 238 aa  457  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  40.7 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  36.51 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 		 308 aa  72  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2331  MscS Mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.48 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 547 aa  58.5  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  34.75 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  37.62 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 549 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  33.66 
 
 		 532 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  34.45 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 538 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 549 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 		 400 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 549 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 544 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0646  MscS Mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  29.09 
 
 		 351 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 551 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 550 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 551 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 547 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 307 aa  52.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0543  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.979226  hitchhiker  0.000989319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 563 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 561 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 540 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0843  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 373 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  27.59 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  35.87 
 
 		 534 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  34.88 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  32.77 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 533 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 		 408 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 400 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  49.7  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30945  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 473 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 299 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0560.2  small-conductance mechanosensitive channel  37.97 
 
 		 429 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  37.84 
 
 		 366 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0593  MscS mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  0.970909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 299 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 550 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  29.61 
 
 		 891 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 785 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1431  MscS mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 331 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.23778  normal  0.0751617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 		 473 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  26.4 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  32.65 
 
 		 307 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 341 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0432  small-conductance mechanosensitive channel  28.26 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000493882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  35.53 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  35.64 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 413 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 404 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 336 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 697 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.52 
 
 		 492 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  32.87 
 
 		 371 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  24.35 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1103 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1115 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 406 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  35 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  34.57 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  35 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  35 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  35 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 429 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  35 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  35 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  33.33 
 
 		 343 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  40.48 
 
 		 358 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  33.33 
 
 		 343 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>