More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3252 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 316 aa  616  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  41.45 
 
 		 233 aa  92.8  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  36.51 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  41.23 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  33.52 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  33.52 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.29 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  33.52 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2331  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1637  hypothetical protein  31.41 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  33.52 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  33.51 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  33.51 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  33.51 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  33.51 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  33.51 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  33.51 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  33.51 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  33.51 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  26.18 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  29.1 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0543  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.979226  hitchhiker  0.000989319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  36.61 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  31.62 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  29.95 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1431  MscS mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.23778  normal  0.0751617 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  39.09 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  29.9 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  35.8 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  23.77 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  35.51 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  24.79 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1802  hypothetical protein  26.79 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0727976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  35.19 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  35.19 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  39.84 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  35.19 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  35.19 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  30.52 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  30.6 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  31.21 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  37.4 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0843  MscS mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0752  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  34.07 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0265282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  38.19 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  26.29 
 
 		 891 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.92 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.48 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 785 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  37.19 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0603  MscS Mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  31.48 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  36.21 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  32 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  32.56 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  39.09 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  31.79 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1852  hypothetical protein  38.57 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.677058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  33.63 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  33.63 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  37.4 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  28.29 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 		 859 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  22.78 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  25.15 
 
 		 867 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 813 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>