More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0820 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 307 aa  611  9.999999999999999e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  56.86 
 
 		 308 aa  362  6e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0843  MscS mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0543  MscS mechanosensitive ion channel  37.99 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.979226  hitchhiker  0.000989319 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1616  MscS Mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 329 aa  99.4  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1431  MscS mechanosensitive ion channel  36.87 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.23778  normal  0.0751617 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  28.01 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  25.3 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 389 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  33.95 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2331  MscS Mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.38 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  24.51 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  31.82 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  24.75 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  27.98 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  22.54 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  25.59 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  24.6 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  24.6 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  24.6 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  24.6 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  24.6 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  27.68 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  24.6 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  24.6 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  23.95 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  31.01 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  31.01 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  24.6 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  24.6 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  30.73 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  26.74 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  28.41 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  24.72 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  25.82 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  25.87 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  25.82 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0408  hypothetical protein  30.92 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  26.39 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 550 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  31.21 
 
 		 547 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  28.17 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  24.55 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  29.49 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  29.49 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  23.76 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  29.49 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  22.06 
 
 		 891 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  22.63 
 
 		 785 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  22.91 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  29.49 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  29.49 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  24.51 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>