240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1616 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1616  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 312 aa  616  1e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0843  MscS mechanosensitive ion channel  42.12 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1431  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 331 aa  222  7e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.23778  normal  0.0751617 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0543  MscS mechanosensitive ion channel  43.58 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.979226  hitchhiker  0.000989319 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  42.74 
 
 		 329 aa  198  7e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.8 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  24 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  29.89 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  26.89 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  26.27 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  27.91 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  27.49 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  28.33 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  26.89 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  28.21 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  36.52 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  36.52 
 
 		 271 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  24.65 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  22.86 
 
 		 813 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0457  MscS mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  26.59 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  28.49 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  25.14 
 
 		 479 aa  53.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 		 362 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.2 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 274 aa  52.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 785 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  28.39 
 
 		 891 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  25.15 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  26.63 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  23.66 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.19 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  28.35 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  25.13 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 373 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1199  mechanosensitive ion channel component  24.88 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000786613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 277 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  24.3 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  22.6 
 
 		 374 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  22.6 
 
 		 374 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.58 
 
 		 173 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  22.77 
 
 		 378 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.96 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.96 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  26.87 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  34.71 
 
 		 484 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  22.67 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.91 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 533 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  43.94 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>