177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1868 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 316 aa  635    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  28.01 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0843  MscS mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1431  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.23778  normal  0.0751617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0543  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.979226  hitchhiker  0.000989319 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1616  MscS Mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2331  MscS Mechanosensitive ion channel  25.49 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 508 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  25.7 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  24.27 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 490 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.36 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 475 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.95 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  26.22 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 		 414 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.42 
 
 		 364 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  25.52 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  28.95 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  25.33 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 273 aa  52.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  22.89 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.86 
 
 		 492 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.85 
 
 		 489 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  27.84 
 
 		 531 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  26.5 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  23.92 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  23.44 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  26.29 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  24.75 
 
 		 637 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 493 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  23.38 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 493 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  23.68 
 
 		 421 aa  49.7  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  25.81 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 408 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 		 393 aa  49.3  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 493 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  29.03 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  25.85 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 429 aa  49.3  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  21.9 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 480 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  23.68 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 544 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  32.29 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  23.94 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  23.66 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 		 485 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 268 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  24.66 
 
 		 400 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1637  hypothetical protein  34.38 
 
 		 189 aa  46.6  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  22.16 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 507 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1411  MscS Mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 373 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 404 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  24.15 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 349 aa  45.8  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0426  MscS mechanosensitive ion channel  25.13 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000444789  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>