More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1897 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  100 
 
 		 233 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  40.7 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  41.45 
 
 		 316 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2331  MscS Mechanosensitive ion channel  33.53 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  41.75 
 
 		 429 aa  65.1  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 389 aa  62  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  45.12 
 
 		 304 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  27.43 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  39.8 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  28.41 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1802  hypothetical protein  39.5 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0727976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  27.11 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  34.93 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  36.03 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.06 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0752  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.84 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0265282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  29.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  27.46 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  29.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  29.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  29.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  29.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  28.74 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  29.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1492  hypothetical protein  31.54 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 		 393 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 501 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1852  hypothetical protein  42.47 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.677058 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0603  MscS Mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 404 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  33.62 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  37.61 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  29.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  43.84 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  29.68 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 345 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1630  MscS Mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 303 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 492 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 360 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  26.47 
 
 		 351 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  25.34 
 
 		 360 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.39 
 
 		 173 aa  52.4  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  33.61 
 
 		 281 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  25.34 
 
 		 359 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 362 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  39.02 
 
 		 359 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  28.15 
 
 		 343 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  28.15 
 
 		 343 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 293 aa  52  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  28.15 
 
 		 343 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  28.15 
 
 		 343 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  28.15 
 
 		 343 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 356 aa  52  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 868 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.56 
 
 		 490 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1637  hypothetical protein  43.84 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 327 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 329 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 493 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  41.38 
 
 		 507 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 362 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  27.34 
 
 		 343 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  30.83 
 
 		 284 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  33.66 
 
 		 532 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  38.67 
 
 		 563 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 910 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  27.34 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  27.34 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  27.34 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 479 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 338 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  27.34 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.34 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 489 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  27.34 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>