143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1431 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1431  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 331 aa  653    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.23778  normal  0.0751617 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0543  MscS mechanosensitive ion channel  75.94 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.979226  hitchhiker  0.000989319 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0843  MscS mechanosensitive ion channel  61.99 
 
 		 324 aa  424  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  58.82 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1616  MscS Mechanosensitive ion channel  44.53 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  36.87 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  35.52 
 
 		 308 aa  89.7  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  28.17 
 
 		 794 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 356 aa  52.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 279 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.75 
 
 		 1144 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  30.52 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  34.82 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  25.85 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 401 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  29.32 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  24.37 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.94 
 
 		 280 aa  46.6  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 533 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 258 aa  46.2  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 307 aa  46.2  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 292 aa  46.2  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 352 aa  46.2  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  29.82 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  29.82 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  27.07 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  27.07 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  26.78 
 
 		 1115 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  29.82 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  29.82 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 627 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  29.82 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.82 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  26.59 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  26.59 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  32.22 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  24.03 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  26.59 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 540 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  26.59 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  25.22 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  26.59 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  29.82 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  25.71 
 
 		 1070 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 475 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 551 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 550 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 551 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  22.86 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 200 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 538 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 429 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 475 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  26.84 
 
 		 1133 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  25.14 
 
 		 1080 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 544 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 1066 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>