131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0599 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 329 aa  661    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0843  MscS mechanosensitive ion channel  58.39 
 
 		 324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1431  MscS mechanosensitive ion channel  55.79 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.23778  normal  0.0751617 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0543  MscS mechanosensitive ion channel  55.84 
 
 		 325 aa  382  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.979226  hitchhiker  0.000989319 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1616  MscS Mechanosensitive ion channel  42.74 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2331  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.52 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  26.57 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  27.64 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  26.01 
 
 		 794 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  25.88 
 
 		 891 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  24.9 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 		 785 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 292 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 475 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 		 538 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  26.39 
 
 		 813 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 428 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 479 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 561 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  24.86 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.03 
 
 		 806 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 551 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 550 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 551 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  25.27 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  25.85 
 
 		 545 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  27.78 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.14 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  26.17 
 
 		 271 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  21.55 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  26.88 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  24.63 
 
 		 435 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 549 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  27.27 
 
 		 531 aa  46.2  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 549 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  27.27 
 
 		 624 aa  46.2  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 		 435 aa  46.2  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 549 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  24.57 
 
 		 1144 aa  46.2  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 285 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  29.74 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  24.49 
 
 		 545 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  21.78 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  24.27 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.33 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  21.9 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  26.9 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  48 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  26.38 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  23.94 
 
 		 550 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 1070 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 		 427 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  25.35 
 
 		 474 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 		 258 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 456 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  27.94 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 1067 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 1072 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 1072 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 1072 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>