More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2331 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2331  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 276 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  33.53 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30945  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  34.29 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  24.88 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  25.49 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  25.14 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  27.47 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  26.74 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  32.82 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.45 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.45 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  26.67 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.59 
 
 		 173 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  25.42 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  31.87 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  26.37 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  31.87 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 475 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  31.87 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  31.87 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  33.56 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  33.56 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 475 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 475 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  31.87 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  31.87 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  33.56 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  31.87 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  33.56 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  35.9 
 
 		 429 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  31.87 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  32.67 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  32.88 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  37.82 
 
 		 490 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 508 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  27.71 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 378 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  21.74 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 360 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 480 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  27.04 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 360 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 544 aa  52.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 485 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 359 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 		 283 aa  52  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 547 aa  52  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  24.64 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  26.25 
 
 		 366 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 473 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  25.35 
 
 		 481 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  28.96 
 
 		 373 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 		 550 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 532 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 406 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  36.96 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>