More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0603 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0603  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 205 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0752  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  52.4 
 
 		 232 aa  181  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0265282 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1492  hypothetical protein  60.39 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1802  hypothetical protein  45.99 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0727976 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  46.28 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1637  hypothetical protein  46.45 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1852  hypothetical protein  48.42 
 
 		 191 aa  121  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.677058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  36.07 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  47.14 
 
 		 389 aa  72  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 308 aa  67  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  46.05 
 
 		 279 aa  67  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 429 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  46.48 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  31.61 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  35.63 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  40.79 
 
 		 359 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  40.79 
 
 		 360 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  40.79 
 
 		 360 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  39.47 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  37.78 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  37.38 
 
 		 547 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  34.51 
 
 		 891 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  37.84 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 414 aa  62.4  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 278 aa  62  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 549 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 549 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 549 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 843 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  37.38 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  37.25 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 844 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  40.79 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  36.46 
 
 		 785 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  31.45 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  36.46 
 
 		 550 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 538 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  43.37 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 859 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.63 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  40.79 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  35.06 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 874 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  42.25 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 551 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 551 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 830 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  36.17 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.65 
 
 		 806 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  34.18 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  41.33 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  35.56 
 
 		 534 aa  55.1  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  37.68 
 
 		 1127 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 796 aa  54.7  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 376 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  32.65 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  32.65 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  32.65 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  34.91 
 
 		 366 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  32.65 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  29.87 
 
 		 429 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  32.65 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  32.65 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 316 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  32.65 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  37.65 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 459 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  35.37 
 
 		 376 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>