More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1852 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1852  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  366  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.677058 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1802  hypothetical protein  81.58 
 
 		 187 aa  286  9e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0727976 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  82.72 
 
 		 189 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1637  hypothetical protein  79.41 
 
 		 189 aa  238  5e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0752  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  47.87 
 
 		 232 aa  134  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0265282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0603  MscS Mechanosensitive ion channel  52.26 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1492  hypothetical protein  53.47 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  39.64 
 
 		 304 aa  74.7  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 429 aa  72  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  41.46 
 
 		 460 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  41.46 
 
 		 460 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  47.06 
 
 		 389 aa  68.6  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  40.74 
 
 		 449 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  40.74 
 
 		 449 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.74 
 
 		 450 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.74 
 
 		 450 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  40.24 
 
 		 450 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  40.74 
 
 		 450 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 		 268 aa  67.8  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.74 
 
 		 450 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.74 
 
 		 450 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  43.42 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  45.59 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  33.13 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  43.66 
 
 		 279 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  44.29 
 
 		 421 aa  67  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  41.77 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  43.28 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  43.75 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  45.07 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  42.65 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  37.8 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  32.67 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  43.66 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  44.29 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  40.26 
 
 		 286 aa  62  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  32.67 
 
 		 532 aa  61.6  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  39.51 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  35.77 
 
 		 298 aa  61.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  41.43 
 
 		 330 aa  61.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  31.53 
 
 		 563 aa  61.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 294 aa  61.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  39.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  41.43 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  39.51 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  42.03 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  39.74 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  37.86 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  40.58 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  37.14 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  29.45 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 538 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 549 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  40.58 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 549 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 549 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  40.58 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 544 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  40.58 
 
 		 505 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 551 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 551 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  35.9 
 
 		 429 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  38.67 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 550 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  41.33 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 540 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 843 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  32.71 
 
 		 357 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  40.58 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  37.86 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  35.51 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 844 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  40.58 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  28.68 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  38.68 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  27.66 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  34.26 
 
 		 561 aa  57  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  28.68 
 
 		 271 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>