More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0752 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0752  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  100 
 
 		 232 aa  460  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0265282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0603  MscS Mechanosensitive ion channel  59.75 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1492  hypothetical protein  49.04 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1802  hypothetical protein  44.39 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0727976 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  43.39 
 
 		 189 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1637  hypothetical protein  48.28 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1852  hypothetical protein  47.87 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.677058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 400 aa  75.9  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  43.21 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  45.45 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 408 aa  68.6  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  37.96 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  41.43 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  42.25 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  37.97 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  42.39 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  41.77 
 
 		 283 aa  62  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  40.79 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  33.9 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  32.84 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  33.9 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  35.51 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  34.31 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  42.67 
 
 		 637 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  29.25 
 
 		 891 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 549 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 874 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 549 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  40.54 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 785 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 830 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 551 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  38.82 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  40.51 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  41.77 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  40.51 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  39.74 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.86 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0102  MscS mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.102568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  37.33 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  36.99 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  29.35 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  36.26 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.37 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  28.86 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  32.95 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.86 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  28.86 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.86 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  36.99 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  36.99 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1616  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.19083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  28.86 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.86 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  37.89 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  37.8 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  27.87 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  30.43 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  38.67 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>