122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0961 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  97.33 
 
 		 181 aa  295  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  97.33 
 
 		 181 aa  295  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  97.33 
 
 		 181 aa  292  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  96 
 
 		 181 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  95.33 
 
 		 181 aa  290  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  96 
 
 		 181 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  96 
 
 		 181 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  96 
 
 		 181 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  82.68 
 
 		 211 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  69.29 
 
 		 179 aa  213  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  69.59 
 
 		 178 aa  210  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  67.63 
 
 		 183 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  64.39 
 
 		 197 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  63.7 
 
 		 199 aa  175  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  51.52 
 
 		 184 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  40.71 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  40.8 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  38.85 
 
 		 181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  44.54 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  36.96 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  34.86 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  34.62 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  27.27 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  27.27 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0105  hypothetical protein  53.7 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  24.77 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.97 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.97 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  35.92 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  27.68 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  35.06 
 
 		 192 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  35.06 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.98 
 
 		 226 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  35.53 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 308 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 298 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  37.78 
 
 		 195 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  37.78 
 
 		 195 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  24.17 
 
 		 273 aa  46.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 306 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  32.14 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  36.99 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  36.99 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  39.73 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  22.76 
 
 		 593 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 305 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  34.67 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 345 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.33 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  26.67 
 
 		 309 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.6 
 
 		 275 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 262 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  27.91 
 
 		 268 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 276 aa  42.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  26.23 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  23.88 
 
 		 255 aa  42.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 293 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 275 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  26.23 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  26.23 
 
 		 286 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  26.23 
 
 		 286 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  25.26 
 
 		 351 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  21.8 
 
 		 281 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0426  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 273 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000444789  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  23.4 
 
 		 307 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  26.23 
 
 		 286 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  26.23 
 
 		 286 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  26.23 
 
 		 286 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  26.23 
 
 		 286 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 389 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  26.23 
 
 		 286 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 421 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 358 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  25.76 
 
 		 288 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  27.05 
 
 		 286 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 279 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4420  MscS mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 279 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0689552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 270 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  22.58 
 
 		 261 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 261 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 283 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 274 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 307 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.07 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  26.23 
 
 		 286 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  26.23 
 
 		 286 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  26.23 
 
 		 286 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  26.23 
 
 		 286 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>