55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00718 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  46.94 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  33.85 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  34.2 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  40.71 
 
 		 176 aa  85.9  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  37.17 
 
 		 176 aa  85.1  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  31.35 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  32.58 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  32.58 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  32.58 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  29.19 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  35.64 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  34.62 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  34.62 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  34.62 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  34.62 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  34.62 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  34.62 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  30.77 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  29.36 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  31.63 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  30.56 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0105  hypothetical protein  44.07 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.77 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 279 aa  49.3  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 408 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  28.08 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 389 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.56 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  25.93 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  25.93 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.87 
 
 		 383 aa  45.1  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 385 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.43 
 
 		 280 aa  44.7  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  24.87 
 
 		 383 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.58 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  32.33 
 
 		 435 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 427 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.18 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 429 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.18 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  22.86 
 
 		 753 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  23.43 
 
 		 732 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 345 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 752 aa  42.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 413 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 444 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 376 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 358 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 		 356 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 272 aa  42  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 384 aa  41.6  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>