More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0787 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  345  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  56.74 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  44.3 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  39.05 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  39.63 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  37.74 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  35.71 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  40.8 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  36.42 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  38.26 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  36.02 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  34.94 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  32.76 
 
 		 200 aa  88.2  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  40.71 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  25.45 
 
 		 199 aa  77.4  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  25.17 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  25.17 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.17 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.18 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0105  hypothetical protein  50.85 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  31.14 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  34.45 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.15 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.2 
 
 		 222 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.67 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  30.52 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  27.44 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  28.28 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  28.28 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 421 aa  57  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  29.17 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  29.33 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  28.47 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  28.47 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  26.76 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  22.99 
 
 		 414 aa  55.1  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 282 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  22.09 
 
 		 400 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 275 aa  53.9  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 262 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  33.62 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.09 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 273 aa  52.4  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 302 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 293 aa  52.4  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  24.82 
 
 		 389 aa  52.4  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  34.34 
 
 		 276 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 268 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  21.56 
 
 		 283 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 356 aa  52  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  28.67 
 
 		 307 aa  51.6  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  23.72 
 
 		 429 aa  51.6  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 261 aa  51.2  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  25.42 
 
 		 1117 aa  51.6  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 279 aa  51.6  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  38.81 
 
 		 189 aa  51.2  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 320 aa  51.2  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 278 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 278 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.21 
 
 		 383 aa  51.2  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  21.88 
 
 		 1144 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 308 aa  51.2  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 383 aa  50.8  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  21.56 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0408  hypothetical protein  28.83 
 
 		 282 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 277 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  25 
 
 		 238 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 283 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  30.56 
 
 		 281 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 270 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 298 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 278 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  24.2 
 
 		 843 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  28.81 
 
 		 249 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.31 
 
 		 280 aa  49.3  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  26.83 
 
 		 343 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  26.83 
 
 		 343 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  26.83 
 
 		 343 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  26.83 
 
 		 343 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  26.83 
 
 		 343 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  25.61 
 
 		 279 aa  48.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 275 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0457  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 277 aa  48.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 277 aa  47.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  26.92 
 
 		 351 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1139  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 294 aa  47.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3406  MscS mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 277 aa  47.8  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>