231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3136 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  393  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  37.74 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.72 
 
 		 222 aa  97.8  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  37.57 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  31.06 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  31.06 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  37.85 
 
 		 179 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  34.32 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  35.1 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  34.32 
 
 		 222 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  37.1 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  39.02 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  37.11 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  37.57 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  36.99 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  37.34 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  40.32 
 
 		 245 aa  85.5  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  37.21 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  37.21 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  38.01 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  25.45 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  27.74 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  24.69 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  25 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  23.33 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  25.32 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  26.22 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 389 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  26.67 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  33.94 
 
 		 534 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  27.68 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  24.32 
 
 		 400 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  24.84 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  27.68 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  27.68 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  27.68 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  27.68 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 301 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  23.95 
 
 		 275 aa  53.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  27.68 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  25.98 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  27.91 
 
 		 474 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  27.68 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  27.68 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 327 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  30.38 
 
 		 343 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  27.68 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 414 aa  52  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 310 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  30.38 
 
 		 343 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 343 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  30.38 
 
 		 343 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  30.38 
 
 		 343 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  30.38 
 
 		 343 aa  51.6  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 343 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  30.38 
 
 		 343 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.38 
 
 		 343 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  29.73 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04171  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  32.76 
 
 		 370 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.610357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  23.18 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 306 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  23.31 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 268 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 307 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  30.39 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  24.69 
 
 		 408 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  26.22 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 549 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 549 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 549 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 287 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 268 aa  48.5  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 283 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 270 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2662  hypothetical protein  29.61 
 
 		 298 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.466989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  30.56 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  21.88 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 544 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  32.14 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  27.27 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  27.27 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 373 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  41.43 
 
 		 538 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  27.27 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  27.27 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  27.27 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 550 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 547 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 551 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  27.27 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>