75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3252 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  100 
 
 		 222 aa  440  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  99.55 
 
 		 222 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  59.91 
 
 		 226 aa  252  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  63.85 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  64.95 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  51.09 
 
 		 187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  58.24 
 
 		 179 aa  188  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  58.43 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  55 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  56.22 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  56.22 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  52.85 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  54.55 
 
 		 197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  61.24 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  61.85 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  51.05 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  35.64 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.77 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  31.66 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  29.94 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  28.48 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  28.16 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  29.17 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  27.47 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  27.47 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  28.12 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  27.54 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  33 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  31.03 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  31.54 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  31.86 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  31.86 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  31.86 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  31.86 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  30.97 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.73 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  31.68 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  28.73 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  31.68 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  30.97 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  31.68 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  22.52 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  22.49 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  34.02 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  25.95 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 321 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  30.93 
 
 		 351 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 288 aa  45.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.23 
 
 		 276 aa  45.1  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  32.18 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  24.39 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  24.08 
 
 		 561 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1197  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  26.88 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 		 283 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 369 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  27.66 
 
 		 278 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 307 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 276 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  25.15 
 
 		 534 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 344 aa  42  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.394899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0105  hypothetical protein  48.78 
 
 		 61 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 356 aa  41.6  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 		 301 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.92 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 275 aa  41.6  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>