281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12023 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  48.94 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  44.3 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  36.87 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  39.74 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  39.1 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  36.21 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  34.46 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  34.46 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  36.54 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  34.68 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  40.6 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  38.85 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  34.86 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  33.53 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  31.69 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  31.39 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0105  hypothetical protein  49.18 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  31.63 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  30.95 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  30.95 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  33.55 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  34.42 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  31.86 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 275 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  24.84 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 637 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 310 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  30.97 
 
 		 287 aa  52  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  26.21 
 
 		 494 aa  51.2  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 835 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 		 891 aa  51.2  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  32.69 
 
 		 308 aa  51.2  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 785 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 369 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 856 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.13 
 
 		 291 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  24.49 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2475  MscS Mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 334 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288536  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.57 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 809 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  27.56 
 
 		 269 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 344 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  36.54 
 
 		 274 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  29.13 
 
 		 803 aa  48.5  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 275 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 275 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 275 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 298 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  24.17 
 
 		 421 aa  48.5  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 275 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 297 aa  48.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 288 aa  48.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  26.62 
 
 		 270 aa  48.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 277 aa  48.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  25.95 
 
 		 310 aa  48.5  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 258 aa  48.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  35.58 
 
 		 275 aa  48.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  20.92 
 
 		 400 aa  47.8  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 389 aa  47.8  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 307 aa  47.8  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 276 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 322 aa  47.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 275 aa  47.8  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 302 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  30.11 
 
 		 268 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  24.84 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.27 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  24.68 
 
 		 883 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 369 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 685 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.27 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  26.35 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 813 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 391 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 279 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 321 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 479 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.84 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 321 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 		 294 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.84 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>