More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2465 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  495  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0505  MscS Mechanosensitive ion channel  85.83 
 
 		 254 aa  402  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.271457  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0300  hypothetical protein  51.59 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1441  mechanosensitive ion channel  55.88 
 
 		 262 aa  258  9e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2247  hypothetical protein  50 
 
 		 262 aa  221  8e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  34.75 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.57 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  27.95 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.57 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  27.03 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.03 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00678  mechanosensitive ion channel family protein  29.37 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.096226  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  30.46 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  24.68 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  27.85 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  27.85 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  27.85 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  27.85 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  27.85 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  27.85 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  27.85 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  27.85 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 547 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 809 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 550 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 544 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 		 533 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  26.86 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0487  MscS Mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  30.67 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0463  MscS mechanosensitive ion channel  25.34 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2526  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.27 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 429 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 362 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  31.06 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 538 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  26.78 
 
 		 369 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  29.87 
 
 		 301 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.05 
 
 		 563 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 285 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  27.27 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  31.58 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  31.58 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  26.32 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.09 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.66 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  31.58 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  31.58 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 540 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  25.34 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>