More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0593 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0593  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 291 aa  576  1.0000000000000001e-163  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  0.970909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0646  MscS Mechanosensitive ion channel  49.13 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  28.79 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  26.34 
 
 		 825 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  22.74 
 
 		 389 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  26.32 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 795 aa  62.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0886  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.36483  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  30.3 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  31.62 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  25.87 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.13 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  30.77 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1649  MscS Mechanosensitive ion channel  31.21 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  22.76 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  29.01 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  35.77 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0700  hypothetical protein  26.67 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.744044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  30.77 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  30.77 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  30.77 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  30.77 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  30.77 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.77 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  23.38 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  26.01 
 
 		 807 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  30.77 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  30.77 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  26.85 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  30.77 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  30.77 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  30.77 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  25.91 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  27.1 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  24.87 
 
 		 732 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  23.85 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  23.68 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 867 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  30.2 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  27.34 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  24.26 
 
 		 864 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  32.87 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  21.05 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  23.61 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19990  small-conductance mechanosensitive channel  27.72 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.81 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  29.46 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  24.81 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.81 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  25.4 
 
 		 891 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.26 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  33.12 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  31.58 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  29.53 
 
 		 807 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30945  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  37.86 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  23.66 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  33.54 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 447 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 981 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 803 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>