More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1893 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01755  predicted diguanylate cyclase  68.35 
 
 		 496 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1856  diguanylate cyclase  68.35 
 
 		 496 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1405  diguanylate cyclase  68.55 
 
 		 496 aa  725    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.856707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2073  ggdef domain-containing protein  99.2 
 
 		 497 aa  1023    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  hitchhiker  0.000116677 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01743  hypothetical protein  68.35 
 
 		 496 aa  724    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1375  ggdef domain protein  99.2 
 
 		 497 aa  1023    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.789677  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1893  ggdef domain protein  100 
 
 		 497 aa  1030    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2510  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  68.35 
 
 		 496 aa  724    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.291593  normal  0.751069 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2010  diguanylate cyclase  68.35 
 
 		 496 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1846  diguanylate cyclase  68.35 
 
 		 496 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0897436 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1872  diguanylate cyclase  68.35 
 
 		 496 aa  724    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.320559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1392  ggdef domain protein  99.2 
 
 		 497 aa  1019    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1409  ggdef domain-containing protein  99.4 
 
 		 497 aa  1024    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2038  ggdef domain protein  68.68 
 
 		 198 aa  260  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1061  membrane associated GGDEF protein  29.18 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  34 
 
 		 443 aa  100  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0280  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.27 
 
 		 314 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0265413 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0952  membrane associated GGDEF protein  28.42 
 
 		 416 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.343928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  33.95 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0237  diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.55 
 
 		 730 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.85 
 
 		 675 aa  94.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  35.76 
 
 		 569 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  27.73 
 
 		 492 aa  95.1  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.76 
 
 		 301 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  32.9 
 
 		 620 aa  94.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.08 
 
 		 314 aa  94.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2077  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 382 aa  94  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.793636  normal  0.406002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01448  predicted diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 347 aa  94  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01461  hypothetical protein  30.77 
 
 		 347 aa  94  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0088  PAS:GGDEF  29.94 
 
 		 335 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3012  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.65 
 
 		 833 aa  92.8  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2157  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0941263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.88 
 
 		 469 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1575  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 852 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 532 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1099  response regulator receiver domain-containing protein  34.42 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.076371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2103  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  31.87 
 
 		 563 aa  93.2  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2167  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1679  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0098  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.8 
 
 		 642 aa  92.8  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1683  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  31.65 
 
 		 753 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3563  cyclic nucleotide-binding protein  32.95 
 
 		 312 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2045  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 243 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 1073 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 833 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  33.74 
 
 		 554 aa  91.3  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  30.72 
 
 		 378 aa  91.3  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.73 
 
 		 434 aa  90.9  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1324  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  34.59 
 
 		 437 aa  90.9  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.799769  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  32.7 
 
 		 319 aa  90.5  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4307  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.9 
 
 		 708 aa  90.5  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245048  normal  0.0798721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0304  sensory box/GGDEF domain protein  30.12 
 
 		 332 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0689  putative diguanylate cyclase  32.53 
 
 		 306 aa  90.1  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5593  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.21 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  29.06 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2884  diguanylate cyclase  28.92 
 
 		 316 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000365079 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  34.62 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000284  putative two-component response regulator and GGDEF family protein YeaJ  25.48 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1067  diguanylate cyclase  32.02 
 
 		 490 aa  89.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4536  diguanylate cyclase  22.56 
 
 		 503 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 457 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  30.98 
 
 		 493 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  33.71 
 
 		 629 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4153  diguanylate cyclase  30.81 
 
 		 305 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  33.55 
 
 		 418 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  37.09 
 
 		 1428 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1984  threonine dehydratase  34.19 
 
 		 418 aa  89  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.241676  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1908  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.27 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11693  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4127  diguanylate cyclase  30.81 
 
 		 305 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0339065  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0031  diguanylate cyclase  32.68 
 
 		 501 aa  89  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0530472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0723  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1063  diguanylate cyclase  32.68 
 
 		 366 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 778 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0699  diguanylate cyclase  32.28 
 
 		 226 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.642785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2546  diguanylate cyclase  29.91 
 
 		 564 aa  88.6  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0032266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2489  diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 836 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1579  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.48 
 
 		 324 aa  88.2  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  30.43 
 
 		 414 aa  88.6  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1014  diguanylate cyclase  33.51 
 
 		 552 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.737518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 524 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1220  GGDEF domain-containing protein  31.36 
 
 		 545 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1035  GGDEF domain-containing protein  30.43 
 
 		 544 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00577049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 278 aa  88.2  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  29.02 
 
 		 792 aa  87.8  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  30.6 
 
 		 493 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.97 
 
 		 1413 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  31.87 
 
 		 494 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1051  diguanylate cyclase  28.26 
 
 		 350 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154093  normal  0.979636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2827  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 348 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  29.89 
 
 		 493 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.42 
 
 		 1423 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  25.61 
 
 		 506 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0096  diguanylate cyclase  32.39 
 
 		 555 aa  87.4  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.64 
 
 		 710 aa  87.4  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1003  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.23 
 
 		 538 aa  87  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>