More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01755 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01755  predicted diguanylate cyclase  100 
 
 		 496 aa  1028    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1856  diguanylate cyclase  99.8 
 
 		 496 aa  1027    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1405  diguanylate cyclase  99.6 
 
 		 496 aa  1026    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.856707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2510  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  99.4 
 
 		 496 aa  1021    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.291593  normal  0.751069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1846  diguanylate cyclase  100 
 
 		 496 aa  1028    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0897436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2073  ggdef domain-containing protein  68.95 
 
 		 497 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  hitchhiker  0.000116677 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1375  ggdef domain protein  68.75 
 
 		 497 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.789677  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1409  ggdef domain-containing protein  68.15 
 
 		 497 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280387 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01743  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1028    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1893  ggdef domain protein  68.35 
 
 		 497 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2010  diguanylate cyclase  99.8 
 
 		 496 aa  1027    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1872  diguanylate cyclase  100 
 
 		 496 aa  1028    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.320559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1392  ggdef domain protein  67.94 
 
 		 497 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2038  ggdef domain protein  97.24 
 
 		 198 aa  359  7e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  34.87 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1003  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.12 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2151  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  30.05 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2149  diguanylate cyclase  33.17 
 
 		 272 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0840549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1775  diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 468 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1732  diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 468 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000238879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  32.72 
 
 		 492 aa  96.7  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2703  diguanylate cyclase  35.06 
 
 		 339 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.54 
 
 		 301 aa  95.1  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  33.72 
 
 		 564 aa  95.1  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1067  diguanylate cyclase  32.96 
 
 		 490 aa  94.7  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0951  membrane associated GGDEF protein  30.38 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0362084  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0952  membrane associated GGDEF protein  25.69 
 
 		 416 aa  94.7  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.343928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2077  diguanylate cyclase  30 
 
 		 382 aa  94.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.793636  normal  0.406002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  30.54 
 
 		 422 aa  93.6  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2153  membrane associated GGDEF protein  28.62 
 
 		 490 aa  93.2  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  34.42 
 
 		 414 aa  93.2  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.99 
 
 		 668 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.75 
 
 		 668 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0983  GGDEF family protein  37.58 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  34.19 
 
 		 620 aa  92.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  32.58 
 
 		 361 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2798  diguanylate cyclase  32.66 
 
 		 296 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.400651 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0098  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.08 
 
 		 642 aa  91.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2204  cellulose synthesis regulatory protein  32.13 
 
 		 570 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.315572  normal  0.912149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  32.58 
 
 		 719 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  35.04 
 
 		 640 aa  91.7  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1132  cellulose synthesis regulatory protein  32.13 
 
 		 570 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1253  cellulose synthesis regulatory protein  32.13 
 
 		 570 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.839594 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  29.17 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2150  cellulose synthesis regulatory protein  32.13 
 
 		 570 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297138  normal  0.0131316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2146  cellulose synthesis regulatory protein  32.13 
 
 		 570 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.256949  normal  0.163286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3232  hypothetical protein  34.21 
 
 		 498 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0640076  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1269  diguanylate cyclase  30.13 
 
 		 287 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.45 
 
 		 314 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2774  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 530 aa  91.3  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1051  diguanylate cyclase  32.51 
 
 		 350 aa  91.3  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154093  normal  0.979636 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1061  membrane associated GGDEF protein  24.43 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.648754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01448  predicted diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 347 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01461  hypothetical protein  33.14 
 
 		 347 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3474  diguanylate cyclase  32.22 
 
 		 393 aa  90.9  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1099  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 390 aa  90.9  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.076371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1679  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 460 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  29.59 
 
 		 411 aa  90.5  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0689  putative diguanylate cyclase  30.72 
 
 		 306 aa  90.5  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1683  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 460 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2167  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 460 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  31.43 
 
 		 473 aa  90.5  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2103  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2157  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0941263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1575  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1410  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 497 aa  90.1  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1365  diguanylate cyclase  31.48 
 
 		 276 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3961  diguanylate cyclase  36.13 
 
 		 340 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042208 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.77 
 
 		 675 aa  89.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  30.69 
 
 		 409 aa  89.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  31.29 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1107  two component signal transduction response regulator  33.71 
 
 		 323 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3440  diguanylate cyclase  29.61 
 
 		 557 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0125075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0627  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 1052 aa  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.256226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2624  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 296 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.65 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1652  diguanylate cyclase  31.9 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.749875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.38 
 
 		 809 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0705  diguanylate cyclase  32.5 
 
 		 311 aa  89  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1646  GGDEF family protein  31.66 
 
 		 296 aa  89  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  33.52 
 
 		 609 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.38 
 
 		 713 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1498  diguanylate cyclase  31.31 
 
 		 296 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  33.52 
 
 		 709 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1462  diguanylate cyclase  31.31 
 
 		 296 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3509  diguanylate cyclase  28.63 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1150  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.95 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0843  diguanylate cyclase  28.63 
 
 		 384 aa  89.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 494 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2885  diguanylate cyclase  31.31 
 
 		 296 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101841  normal  0.0224227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1467  diguanylate cyclase  31.31 
 
 		 296 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 		 593 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0280  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.14 
 
 		 314 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0265413 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1586  diguanylate cyclase  31.71 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3638  diguanylate cyclase  28.63 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.882001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2051  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 307 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 		 1644 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1365  diguanylate cyclase  32.69 
 
 		 292 aa  88.6  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>