More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1775 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1732  diguanylate cyclase  99.79 
 
 		 468 aa  968    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000238879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1775  diguanylate cyclase  100 
 
 		 468 aa  970    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2543  diguanylate cyclase  66.3 
 
 		 473 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000111562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2758  GGDEF family protein  63.91 
 
 		 467 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000284  putative two-component response regulator and GGDEF family protein YeaJ  27.68 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46829  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1061  membrane associated GGDEF protein  30.59 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.648754  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3638  diguanylate cyclase  36.69 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.882001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0843  diguanylate cyclase  36.69 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3509  diguanylate cyclase  36.69 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  35.67 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  34.5 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1872  diguanylate cyclase  33.92 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2370  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 342 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257282  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2092  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 342 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0157551  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2104  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  27.13 
 
 		 362 aa  99  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2253  diguanylate cyclase  33.73 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1856  diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 496 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1405  diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 496 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.856707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2010  diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 496 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1228  diguanylate cyclase  34.9 
 
 		 490 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1846  diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 496 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0897436 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01755  predicted diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 496 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1872  diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 496 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.320559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01743  hypothetical protein  26.63 
 
 		 496 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1085  putative sensory box/GGDEF family protein  32.16 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4153  putative sensory box/GGDEF family protein  32.16 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2510  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  27 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.291593  normal  0.751069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3677  diguanylate cyclase  36.13 
 
 		 524 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  32.75 
 
 		 354 aa  95.1  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3954  sensory box/GGDEF family protein  32.16 
 
 		 431 aa  93.2  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3800  sensory box/GGDEF family protein  32.16 
 
 		 431 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0221299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4064  putative sensory box/GGDEF family protein  32.16 
 
 		 431 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00151  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  32.32 
 
 		 353 aa  93.2  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4111  sensory box/GGDEF family protein, putative  32.16 
 
 		 430 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3785  sensory box/GGDEF family protein  32.16 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2989  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 577 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3873  diguanylate cyclase  32.75 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4263  sensory box/GGDEF family protein  32.16 
 
 		 430 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4175  putative sensory box/GGDEF family protein  32.16 
 
 		 430 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00125122  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2413  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 544 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1887  diguanylate cyclase  29.73 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1368  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.22 
 
 		 818 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.567434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3838  diguanylate cyclase  35.42 
 
 		 452 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210475  normal  0.0305933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  38.71 
 
 		 949 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  36.2 
 
 		 568 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  34.44 
 
 		 615 aa  90.9  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 608 aa  90.5  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1290  diguanylate cyclase  34 
 
 		 491 aa  90.5  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2885  diguanylate cyclase  28.44 
 
 		 296 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101841  normal  0.0224227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1467  diguanylate cyclase  28.44 
 
 		 296 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  28.7 
 
 		 485 aa  90.1  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1365  diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 292 aa  90.1  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2984  GGDEF domain-containing protein  33.54 
 
 		 483 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.301535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3837  diguanylate cyclase  34.72 
 
 		 452 aa  90.1  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0314898  normal  0.0363493 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3753  diguanylate cyclase  29.6 
 
 		 485 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3356  GGDEF domain/HAMP domain-containing protein  33.99 
 
 		 533 aa  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.204674  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.52 
 
 		 642 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 354 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.98 
 
 		 791 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0392  diguanylate cyclase  31.74 
 
 		 768 aa  89.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000907702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  28.8 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0276  diguanylate cyclase  27.8 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4804  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 304 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  33.52 
 
 		 624 aa  89  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0279  diguanylate cyclase  27.8 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00774453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1498  diguanylate cyclase  27.98 
 
 		 296 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0280  diguanylate cyclase  27.8 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0381  diguanylate cyclase  31.98 
 
 		 251 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.874327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4907  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 308 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0301785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4872  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 308 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000065621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0272  diguanylate cyclase  27.8 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00420  GGDEF domain protein  33.54 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1462  diguanylate cyclase  27.98 
 
 		 296 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4965  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 308 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00367568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  36.47 
 
 		 455 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3487  GGDEF domain-containing protein  34.81 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1733  diguanylate cyclase  33.56 
 
 		 568 aa  88.2  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0602531  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3616  diguanylate cyclase  34.81 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2896  cellulose binding, type IV  34.52 
 
 		 443 aa  88.2  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808862 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0820  GGDEF domain-containing protein  34.81 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 485 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3282  diguanylate cyclase  34.69 
 
 		 523 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1205  diguanylate cyclase  29.47 
 
 		 371 aa  87.8  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2297  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  32.14 
 
 		 422 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  27.54 
 
 		 620 aa  87.4  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  30.82 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  32.45 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0942  hypothetical protein  29.33 
 
 		 377 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 800 aa  87.4  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0392  diguanylate cyclase  33.16 
 
 		 319 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0549299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3648  formamidopyrimidine-DNA glycolase  31.93 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2102  diguanylate cyclase  32.41 
 
 		 308 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307021  normal  0.599711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2253  diguanylate cyclase  35.76 
 
 		 545 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346813  normal  0.544502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  30.34 
 
 		 333 aa  87  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0912  hypothetical protein  28.78 
 
 		 377 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  36.14 
 
 		 457 aa  87  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0645  diguanylate cyclase  34.3 
 
 		 357 aa  87  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.588566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0633  diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 302 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.4362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>