More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0280 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0280  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 		 314 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0265413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3231  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.66 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.458607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0996  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.38 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.728582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0179  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.8 
 
 		 750 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4113  diguanylate cyclase  34.22 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  35.21 
 
 		 291 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.9 
 
 		 505 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2820  hypothetical protein  32.45 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3138  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.52 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  32.08 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.45 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1599  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.3 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.96 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.57 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.57 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3012  diguanylate cyclase  37.65 
 
 		 428 aa  108  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000172152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1520  GGDEF domain-containing protein  28.46 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1324  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  35.29 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.799769  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  33.16 
 
 		 569 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  31.11 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.27 
 
 		 353 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1682  diguanylate cyclase  34.5 
 
 		 560 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1211  diguanylate cyclase  36.88 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2463  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 637 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.04 
 
 		 642 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1350  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.04 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1412  diguanylate cyclase  37.35 
 
 		 516 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2273  diguanylate cyclase  34.24 
 
 		 563 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0541  diguanylate cyclase  34.27 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1329  diguanylate cyclase  33.95 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3791  diguanylate cyclase  35.68 
 
 		 572 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  32 
 
 		 326 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  35.14 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.03 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4330  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.31 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  34.64 
 
 		 492 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1078  diguanylate cyclase  35.39 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  32.26 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5313  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0932  diguanylate cyclase  44.7 
 
 		 353 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.75045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1202  GGDEF domain-containing protein  26.59 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.952705 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1849  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.17 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0440  diguanylate cyclase AdrA  34.01 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3237  diguanylate cyclase  32.44 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1158  diguanylate cyclase  34.83 
 
 		 507 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  35.8 
 
 		 471 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1397  GAF domain/diguanylate cyclase domain-containing protein  31.17 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.210623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1931  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.22 
 
 		 1289 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0959119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1880  GAF domain/diguanylate cyclase domain-containing protein  31.17 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0138  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 355 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0427  diguanylate cyclase AdrA  34.01 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0015  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.07 
 
 		 847 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0422  diguanylate cyclase AdrA  34.01 
 
 		 370 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1839  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.17 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730013  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1742  diguanylate cyclase  35.37 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0534167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0327  diguanylate cyclase  39.22 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  37.82 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0421  diguanylate cyclase AdrA  34.01 
 
 		 370 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0175  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.16 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.14726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  32.39 
 
 		 381 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2018  GAF domain/diguanylate cyclase domain-containing protein  31.17 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000229251  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  30.62 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 778 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2463  hypothetical protein  28.68 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0482  diguanylate cyclase AdrA  34.01 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0459  diguanylate cyclase AdrA  32.55 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.21 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  27.94 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1357  diguanylate cyclase  35.45 
 
 		 508 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  30.15 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  36.87 
 
 		 464 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  31.23 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00332  predicted diguanylate cyclase  32.55 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3223  diguanylate cyclase  32.55 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0524  diguanylate cyclase  35.62 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3247  diguanylate cyclase AdrA  32.55 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0905888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00336  hypothetical protein  32.55 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0415  diguanylate cyclase AdrA  32.55 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01763  predicted diguanylate cyclase  31.2 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.623306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  32.86 
 
 		 451 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01751  hypothetical protein  31.2 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  29.34 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0567  diguanylate cyclase  30.42 
 
 		 377 aa  99.8  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  35.64 
 
 		 563 aa  99.8  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.18 
 
 		 321 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0698  diguanylate cyclase  34.67 
 
 		 388 aa  99.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814063  hitchhiker  0.00133482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  32.97 
 
 		 718 aa  99.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2858  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.92 
 
 		 368 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0640037  hitchhiker  0.00351788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 450 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0744  diguanylate cyclase  35.59 
 
 		 753 aa  99.4  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165088  normal  0.416995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3263  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.92 
 
 		 368 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5747  diguanylate cyclase  34.97 
 
 		 261 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2505  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  29.85 
 
 		 345 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  34.39 
 
 		 432 aa  99.4  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.47 
 
 		 367 aa  99.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1107  two component signal transduction response regulator  35.43 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  38.85 
 
 		 852 aa  99  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0676  diguanylate cyclase  37.65 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1059  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.3 
 
 		 570 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>