More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1414 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1414  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
440 aa  854    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0801097  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1394  chemotaxis sensory transducer  89.55 
 
 
444 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  78.23 
 
 
441 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4661  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.88 
 
 
440 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 
440 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
440 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178259  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1072  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.68 
 
 
411 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 
434 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3907  chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 
424 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.97 
 
 
434 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
563 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 
672 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.21 
 
 
563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
566 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.8 
 
 
563 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.89 
 
 
675 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.06 
 
 
567 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.45 
 
 
563 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  48.16 
 
 
561 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.53 
 
 
563 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.47 
 
 
716 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.15 
 
 
655 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 
731 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
563 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.26 
 
 
562 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.96 
 
 
673 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.89 
 
 
561 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  48.7 
 
 
438 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.86 
 
 
561 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  40.74 
 
 
552 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  47.21 
 
 
565 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 
656 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 
563 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.53 
 
 
572 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.35 
 
 
688 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.82 
 
 
670 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  48.15 
 
 
561 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
689 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
560 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.46 
 
 
741 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.34 
 
 
419 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 
688 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  38.31 
 
 
714 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.81 
 
 
560 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
586 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 
566 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.53 
 
 
573 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
561 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.43 
 
 
563 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
656 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 
674 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.6 
 
 
561 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.55 
 
 
730 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  48.55 
 
 
563 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  47.58 
 
 
656 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.9 
 
 
564 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
567 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
730 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  39.61 
 
 
602 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 
566 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  46.69 
 
 
691 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.83 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 
567 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.79 
 
 
691 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  48.91 
 
 
688 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.96 
 
 
561 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.43 
 
 
691 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  47.79 
 
 
674 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.2 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  46.07 
 
 
563 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.33 
 
 
564 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.53 
 
 
698 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  45.74 
 
 
561 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.64 
 
 
563 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
563 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7506  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.97 
 
 
671 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.13 
 
 
568 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.1 
 
 
542 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.56 
 
 
568 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  47.25 
 
 
688 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  44.91 
 
 
565 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.96 
 
 
556 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.1 
 
 
712 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
563 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  49.07 
 
 
561 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  39.75 
 
 
688 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
566 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 
565 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.620524  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 
560 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  45.96 
 
 
561 aa  190  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
563 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  46.91 
 
 
562 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.59 
 
 
689 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
563 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.14 
 
 
568 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.69 
 
 
667 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.91 
 
 
686 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.93 
 
 
587 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
577 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.82 
 
 
655 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>