More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7506 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7506  putative methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
671 aa  1293    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  45.89 
 
 
688 aa  316  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.1 
 
 
562 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  48.96 
 
 
688 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.81 
 
 
689 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  47.77 
 
 
565 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.64 
 
 
561 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.06 
 
 
688 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.91 
 
 
688 aa  300  8e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.61 
 
 
542 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.12 
 
 
566 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.02 
 
 
573 aa  293  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  45.95 
 
 
565 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 
566 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.89 
 
 
561 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.2 
 
 
567 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  45.97 
 
 
566 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.29 
 
 
675 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
567 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 
562 aa  281  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 
560 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 
563 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 
655 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.72 
 
 
698 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.86 
 
 
656 aa  277  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  48.27 
 
 
656 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.33 
 
 
561 aa  276  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  47.55 
 
 
712 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  47.88 
 
 
552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  46.72 
 
 
561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 
712 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49 
 
 
562 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  45.93 
 
 
566 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.47 
 
 
711 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  47.49 
 
 
656 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.11 
 
 
562 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
565 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.24 
 
 
586 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  46.87 
 
 
602 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.61 
 
 
674 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 
673 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  47.72 
 
 
698 aa  270  8e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.41 
 
 
672 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  45.72 
 
 
674 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.99 
 
 
563 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  47.17 
 
 
676 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.38 
 
 
689 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 
563 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  45.94 
 
 
562 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.66 
 
 
562 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.86 
 
 
561 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 
568 aa  267  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 
563 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.55 
 
 
568 aa  267  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.56 
 
 
556 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  48.62 
 
 
561 aa  266  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  47.3 
 
 
556 aa  266  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.02 
 
 
562 aa  265  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0245477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.34 
 
 
561 aa  265  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  48.02 
 
 
577 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.26 
 
 
563 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.07 
 
 
558 aa  263  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.176129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 
563 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.55 
 
 
563 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 
731 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
561 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.72 
 
 
575 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 
730 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 
568 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.5 
 
 
572 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 
694 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.02 
 
 
587 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 
563 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.5 
 
 
716 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 
670 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.94 
 
 
561 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4691  chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 
665 aa  258  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.69 
 
 
561 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.24 
 
 
698 aa  257  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 
559 aa  257  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  44.44 
 
 
565 aa  257  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 
674 aa  257  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.38 
 
 
561 aa  257  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 
558 aa  256  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
567 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 
558 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
568 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.01 
 
 
741 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 
656 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.03 
 
 
563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 
561 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
563 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  43.81 
 
 
561 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 
561 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
681 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.93 
 
 
563 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 
655 aa  253  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.04 
 
 
712 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.26 
 
 
561 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
730 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>