More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1072 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1072  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
411 aa  809    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.56 
 
 
440 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178259  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.8 
 
 
440 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1394  chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4661  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.73 
 
 
440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1414  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.68 
 
 
440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0801097  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 
441 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3907  chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
424 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 
434 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 
434 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 
561 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
672 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
561 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 
561 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 
562 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.73 
 
 
566 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 
561 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 
563 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.5 
 
 
730 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.61 
 
 
567 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.62 
 
 
655 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 
566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.69 
 
 
731 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 
689 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  42.91 
 
 
656 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 
681 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.75 
 
 
542 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 
566 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.39 
 
 
688 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 
675 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.07 
 
 
730 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.11 
 
 
563 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 
563 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  36.18 
 
 
565 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 
674 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.16 
 
 
673 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  42.91 
 
 
656 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 
688 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  42.7 
 
 
674 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  42.65 
 
 
688 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 
563 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 
572 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 
564 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.43 
 
 
741 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  41.79 
 
 
707 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.21 
 
 
556 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 
568 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 
563 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  41.24 
 
 
675 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.43 
 
 
563 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.79 
 
 
691 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 
419 aa  167  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 
563 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
563 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.07 
 
 
716 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.18 
 
 
568 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.7 
 
 
563 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 
561 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  41.13 
 
 
565 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
670 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 
602 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.52 
 
 
564 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 
691 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 
567 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 
567 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3665  chemotaxis sensory transducer  39.93 
 
 
567 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.66 
 
 
450 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.89 
 
 
688 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 
428 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.15 
 
 
568 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
573 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.07 
 
 
694 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 
681 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 
561 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 
568 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
563 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 
587 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  41.13 
 
 
566 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.56 
 
 
711 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.54 
 
 
656 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.42 
 
 
698 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 
560 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.15 
 
 
686 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 
564 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0533  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  38.57 
 
 
712 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.595703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  40.52 
 
 
691 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  40.07 
 
 
712 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 
565 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.620524  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.07 
 
 
567 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 
689 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.61 
 
 
712 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.65 
 
 
563 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 
586 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
563 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.55 
 
 
564 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  39.3 
 
 
561 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  41.99 
 
 
563 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.43 
 
 
563 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 
561 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 
561 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>