More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1661 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 618 aa  1263    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  58.33 
 
 		 620 aa  693    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  48.94 
 
 		 618 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  46.17 
 
 		 624 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  46.41 
 
 		 624 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  46.41 
 
 		 624 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  46.41 
 
 		 622 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  43.6 
 
 		 617 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  43.87 
 
 		 609 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 		 606 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  44.26 
 
 		 631 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  42.74 
 
 		 625 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  43.18 
 
 		 630 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  42.93 
 
 		 626 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  41.67 
 
 		 624 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  43.11 
 
 		 635 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  40.93 
 
 		 631 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  44.2 
 
 		 671 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  38.93 
 
 		 617 aa  449  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  42.17 
 
 		 617 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  40.98 
 
 		 626 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  41.96 
 
 		 640 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  39.12 
 
 		 619 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  40.73 
 
 		 648 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  41.31 
 
 		 589 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  42.86 
 
 		 628 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  38.21 
 
 		 619 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  39.37 
 
 		 629 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  42.52 
 
 		 633 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  42.52 
 
 		 633 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  41.89 
 
 		 630 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  40.23 
 
 		 627 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  41.39 
 
 		 635 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  39.26 
 
 		 633 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  37.95 
 
 		 618 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  39.46 
 
 		 627 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  40.75 
 
 		 633 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 631 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  38.41 
 
 		 626 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  37.89 
 
 		 643 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  37.75 
 
 		 599 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  41.13 
 
 		 632 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  38.79 
 
 		 589 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  40.38 
 
 		 611 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  42.36 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  42.36 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  38.16 
 
 		 619 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  37.42 
 
 		 603 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  39.2 
 
 		 605 aa  362  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  36.49 
 
 		 573 aa  327  4.0000000000000003e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  45.05 
 
 		 279 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 560 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  23.74 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  24.71 
 
 		 592 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.01 
 
 		 590 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.59 
 
 		 630 aa  124  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  22.39 
 
 		 598 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  22.35 
 
 		 587 aa  117  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  23.33 
 
 		 598 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  23.48 
 
 		 604 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  27.49 
 
 		 607 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  23.61 
 
 		 597 aa  107  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  26.07 
 
 		 603 aa  103  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  23.8 
 
 		 612 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  24.83 
 
 		 660 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  21.75 
 
 		 596 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  23.91 
 
 		 597 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  23.91 
 
 		 597 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  23.34 
 
 		 612 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  24.95 
 
 		 679 aa  101  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  23.39 
 
 		 597 aa  100  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  23.55 
 
 		 592 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  22.91 
 
 		 611 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  28.92 
 
 		 6768 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  23.82 
 
 		 597 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  22.39 
 
 		 598 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 		 567 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  25.61 
 
 		 606 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  22.7 
 
 		 601 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 610 aa  97.8  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  22.54 
 
 		 601 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  22.77 
 
 		 592 aa  97.1  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  22.54 
 
 		 601 aa  97.1  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.6 
 
 		 603 aa  96.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  24.8 
 
 		 604 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  24.22 
 
 		 606 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  22.28 
 
 		 601 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  22.99 
 
 		 633 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  22.11 
 
 		 598 aa  96.3  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 		 773 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  23.64 
 
 		 609 aa  95.9  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  23.59 
 
 		 607 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  25.05 
 
 		 555 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  26.61 
 
 		 564 aa  95.5  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 561 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 620 aa  94.7  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 		 606 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  22.41 
 
 		 547 aa  94.4  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 		 604 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>