More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4024 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  61.79 
 
 		 589 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  66.07 
 
 		 624 aa  813    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  71.75 
 
 		 640 aa  902    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  60.24 
 
 		 589 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  58.97 
 
 		 626 aa  706    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  58.69 
 
 		 633 aa  718    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  61.87 
 
 		 626 aa  749    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  69.82 
 
 		 671 aa  868    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  56.16 
 
 		 617 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  65.32 
 
 		 618 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  66.56 
 
 		 632 aa  818    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  68.47 
 
 		 633 aa  823    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  59.74 
 
 		 627 aa  726    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  60.53 
 
 		 648 aa  728    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  66.67 
 
 		 630 aa  842    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 633 aa  1293    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  66.67 
 
 		 635 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  65.32 
 
 		 618 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  68.47 
 
 		 633 aa  823    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  67.32 
 
 		 628 aa  829    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  53.1 
 
 		 618 aa  618  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  52.38 
 
 		 619 aa  611  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  53.04 
 
 		 619 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  48.6 
 
 		 606 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  49.27 
 
 		 630 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  47.07 
 
 		 609 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  48.46 
 
 		 631 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  48.46 
 
 		 635 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  43.56 
 
 		 617 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  45.75 
 
 		 643 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  44.89 
 
 		 625 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 618 aa  465  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  46.36 
 
 		 617 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  44.27 
 
 		 611 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  43.53 
 
 		 624 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  43.92 
 
 		 624 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  40.36 
 
 		 619 aa  425  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  40.87 
 
 		 599 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  43.16 
 
 		 631 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  40.75 
 
 		 618 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  42.03 
 
 		 624 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  41.56 
 
 		 622 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  68.93 
 
 		 279 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  40.8 
 
 		 605 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  38.28 
 
 		 627 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  38.13 
 
 		 620 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  38.74 
 
 		 631 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  39.26 
 
 		 629 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  38.23 
 
 		 573 aa  360  6e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  37.44 
 
 		 603 aa  351  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  38.2 
 
 		 626 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 560 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0835  feruloyl-CoA synthetase  52.53 
 
 		 312 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  26.56 
 
 		 630 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  24.39 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 606 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  26.55 
 
 		 606 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  23.66 
 
 		 633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 606 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 592 aa  112  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 567 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  23.9 
 
 		 633 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 		 592 aa  104  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  21.71 
 
 		 610 aa  103  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  22.76 
 
 		 603 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  22.83 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  22.48 
 
 		 610 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 600 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  24.32 
 
 		 597 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  21.37 
 
 		 607 aa  101  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  21.85 
 
 		 590 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  23.05 
 
 		 592 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  24.48 
 
 		 622 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  23.74 
 
 		 746 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.73 
 
 		 610 aa  99  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.73 
 
 		 562 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  22.75 
 
 		 702 aa  98.2  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  26.4 
 
 		 607 aa  97.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  23.01 
 
 		 613 aa  96.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  21.92 
 
 		 610 aa  96.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  23.93 
 
 		 609 aa  95.1  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.62 
 
 		 601 aa  95.5  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  23.99 
 
 		 599 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  23.05 
 
 		 592 aa  94.7  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 616 aa  94.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  24.24 
 
 		 597 aa  94.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 		 663 aa  94  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  26.28 
 
 		 1549 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  23.01 
 
 		 606 aa  93.6  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  22.88 
 
 		 599 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  24.3 
 
 		 607 aa  92.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.07 
 
 		 597 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  23.6 
 
 		 616 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  23.97 
 
 		 610 aa  91.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1468  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.47 
 
 		 563 aa  91.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  23.85 
 
 		 555 aa  91.3  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  24.08 
 
 		 605 aa  91.3  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 620 aa  91.3  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 495 aa  90.9  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.23 
 
 		 610 aa  90.5  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>