More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7119 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  77.37 
 
 		 624 aa  975    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  76.4 
 
 		 624 aa  961    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  79.45 
 
 		 624 aa  1023    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 622 aa  1275    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  50.24 
 
 		 618 aa  628  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  46.41 
 
 		 618 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  47.53 
 
 		 620 aa  525  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  46.14 
 
 		 617 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  46.43 
 
 		 625 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  43.21 
 
 		 626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  44.19 
 
 		 609 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  42.53 
 
 		 619 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  43.11 
 
 		 619 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  43.05 
 
 		 606 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  43.05 
 
 		 619 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  42.67 
 
 		 648 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  44.14 
 
 		 589 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  40.49 
 
 		 617 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  42.67 
 
 		 626 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  44.46 
 
 		 630 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  44.3 
 
 		 635 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  42.02 
 
 		 603 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  44.07 
 
 		 631 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  41.96 
 
 		 633 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  41.79 
 
 		 629 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  41.52 
 
 		 627 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  42.39 
 
 		 631 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  43.67 
 
 		 628 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  42.11 
 
 		 599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  41.85 
 
 		 618 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  44.13 
 
 		 633 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  44.13 
 
 		 633 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  41.99 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  40.79 
 
 		 631 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  40.29 
 
 		 643 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  42.44 
 
 		 630 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  44.35 
 
 		 611 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  41.13 
 
 		 627 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  44.18 
 
 		 640 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  42.95 
 
 		 617 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  42.09 
 
 		 671 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  41.88 
 
 		 589 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  42.88 
 
 		 632 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  41.64 
 
 		 605 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  41.87 
 
 		 626 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  41.76 
 
 		 624 aa  425  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  43.74 
 
 		 618 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  43.74 
 
 		 618 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  41.56 
 
 		 633 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  37.18 
 
 		 573 aa  355  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  43.8 
 
 		 279 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 		 590 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 630 aa  132  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 		 612 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  22.6 
 
 		 587 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  23.49 
 
 		 592 aa  111  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.34 
 
 		 602 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  21.5 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  22.96 
 
 		 592 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  23.27 
 
 		 601 aa  101  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  21.14 
 
 		 602 aa  100  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  22.6 
 
 		 661 aa  100  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  23.32 
 
 		 633 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  23.57 
 
 		 617 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 		 825 aa  98.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  24.13 
 
 		 551 aa  98.6  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  22.98 
 
 		 633 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  31.42 
 
 		 508 aa  97.4  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  25.39 
 
 		 610 aa  97.4  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 557 aa  97.1  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  24.45 
 
 		 606 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  22.48 
 
 		 596 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 606 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  28.05 
 
 		 824 aa  94.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  21.17 
 
 		 601 aa  94.7  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  27.3 
 
 		 825 aa  94.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 606 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0581  AMP-dependent synthetase and ligase  26.93 
 
 		 526 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  23.57 
 
 		 639 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  23.57 
 
 		 639 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.7 
 
 		 513 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  23.04 
 
 		 601 aa  93.6  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 652 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 		 567 aa  92.8  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0249162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  25.73 
 
 		 514 aa  92.8  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  23.36 
 
 		 649 aa  92.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 903 aa  92.8  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.06 
 
 		 610 aa  92  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.79 
 
 		 566 aa  92  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  24.35 
 
 		 554 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  22.52 
 
 		 607 aa  91.3  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  23.39 
 
 		 551 aa  91.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  24.61 
 
 		 555 aa  91.3  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  22.87 
 
 		 604 aa  91.3  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  22.6 
 
 		 547 aa  90.9  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  24.35 
 
 		 554 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 519 aa  90.5  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  22.17 
 
 		 601 aa  90.5  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  22.17 
 
 		 601 aa  90.5  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>