More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5153 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 629 aa  1284    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  42 
 
 		 618 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  42.11 
 
 		 624 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  41.68 
 
 		 624 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  40.86 
 
 		 624 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  42.06 
 
 		 617 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  41.79 
 
 		 622 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  39.37 
 
 		 618 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  39.6 
 
 		 606 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  41.57 
 
 		 625 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  40.8 
 
 		 620 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  42.25 
 
 		 631 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  40.51 
 
 		 626 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  40.53 
 
 		 631 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  42.12 
 
 		 626 aa  418  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  39.17 
 
 		 630 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  39.37 
 
 		 635 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  37.85 
 
 		 609 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  36.39 
 
 		 617 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  38.86 
 
 		 603 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  41.05 
 
 		 640 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  38.16 
 
 		 619 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  39.79 
 
 		 611 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  40.31 
 
 		 617 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  37.5 
 
 		 631 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  39.93 
 
 		 589 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  39.59 
 
 		 633 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  40.23 
 
 		 628 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  39.59 
 
 		 624 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  39.34 
 
 		 648 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  40.3 
 
 		 633 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  40.3 
 
 		 633 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  38.67 
 
 		 627 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  41.01 
 
 		 630 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  37.03 
 
 		 618 aa  381  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  39.62 
 
 		 589 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  40.34 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  39.26 
 
 		 633 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  37.56 
 
 		 627 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  39.05 
 
 		 671 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  37.58 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  38.63 
 
 		 605 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  36.77 
 
 		 599 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  40.82 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  37.29 
 
 		 619 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  40.82 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  40.34 
 
 		 632 aa  363  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  36.5 
 
 		 626 aa  359  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  36.36 
 
 		 643 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  37.2 
 
 		 573 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  41.67 
 
 		 279 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 560 aa  173  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 		 592 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 612 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  23.89 
 
 		 587 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.91 
 
 		 590 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  25.33 
 
 		 604 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  24.79 
 
 		 679 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  25.94 
 
 		 633 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  24.4 
 
 		 602 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.01 
 
 		 612 aa  130  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  26.91 
 
 		 607 aa  128  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24 
 
 		 601 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.45 
 
 		 602 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 606 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  24.22 
 
 		 596 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 606 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 		 620 aa  123  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  24.05 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.02 
 
 		 606 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  21.63 
 
 		 598 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  23.47 
 
 		 555 aa  117  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  23.65 
 
 		 599 aa  117  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  21.63 
 
 		 601 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  21.63 
 
 		 601 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  21.63 
 
 		 601 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  24.2 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  21.69 
 
 		 611 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  21.61 
 
 		 601 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  24.01 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  23.32 
 
 		 567 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  23.7 
 
 		 605 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  25.63 
 
 		 1549 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  21.39 
 
 		 598 aa  114  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.8 
 
 		 606 aa  114  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  25.24 
 
 		 616 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  24.57 
 
 		 1168 aa  114  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.92 
 
 		 614 aa  114  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  21.23 
 
 		 598 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 595 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.97 
 
 		 598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 590 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  23.18 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2510  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 		 1549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2423  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 		 1549 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  25.82 
 
 		 1174 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  24.54 
 
 		 610 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>