More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0796 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  78.16 
 
 		 619 aa  1016    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  78.64 
 
 		 619 aa  1022    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  71.64 
 
 		 617 aa  928    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  56.21 
 
 		 626 aa  691    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  51.82 
 
 		 626 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 618 aa  1273    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  53.03 
 
 		 671 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  51.07 
 
 		 633 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  51.47 
 
 		 627 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  53.1 
 
 		 633 aa  618  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  51.8 
 
 		 589 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  52.36 
 
 		 589 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  50.91 
 
 		 624 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  52.26 
 
 		 648 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  51.32 
 
 		 640 aa  601  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  49.84 
 
 		 631 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  49.68 
 
 		 630 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  49.02 
 
 		 635 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  48.5 
 
 		 609 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  49.17 
 
 		 606 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  48.19 
 
 		 630 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  47.78 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  48.02 
 
 		 628 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  48.91 
 
 		 633 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  48.91 
 
 		 633 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  47.62 
 
 		 632 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  49.4 
 
 		 618 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  49.4 
 
 		 618 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  42.88 
 
 		 617 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  44.41 
 
 		 643 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  45.38 
 
 		 617 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  45.52 
 
 		 625 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  40.99 
 
 		 618 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  43.46 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  41.32 
 
 		 599 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  40.98 
 
 		 624 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  41.85 
 
 		 622 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  42.29 
 
 		 605 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  39.47 
 
 		 619 aa  425  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  37.95 
 
 		 618 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  40.75 
 
 		 624 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  41.11 
 
 		 631 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  41.2 
 
 		 624 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  39.69 
 
 		 573 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  37.01 
 
 		 627 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  37.17 
 
 		 620 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  37.03 
 
 		 629 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  37.38 
 
 		 631 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  38.16 
 
 		 626 aa  336  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  36.61 
 
 		 603 aa  326  7e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  49.44 
 
 		 279 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 		 590 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  23.7 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  24.03 
 
 		 598 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.42 
 
 		 630 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  23.86 
 
 		 597 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 567 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 		 592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  24.16 
 
 		 612 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  28.13 
 
 		 527 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  24.03 
 
 		 598 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  23.99 
 
 		 598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  23.99 
 
 		 597 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  22.6 
 
 		 596 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  23.24 
 
 		 679 aa  110  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 528 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  21.86 
 
 		 610 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  24.43 
 
 		 604 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  21.61 
 
 		 610 aa  109  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  24.5 
 
 		 606 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  24.13 
 
 		 606 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  23.4 
 
 		 598 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  23.82 
 
 		 597 aa  108  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  24.35 
 
 		 598 aa  108  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  23.04 
 
 		 592 aa  108  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  23.75 
 
 		 633 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  23.82 
 
 		 597 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  24.89 
 
 		 633 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  24.32 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 		 903 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.14 
 
 		 610 aa  106  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  24.17 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  23.9 
 
 		 597 aa  105  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  22.11 
 
 		 607 aa  104  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  23.14 
 
 		 568 aa  104  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  23.1 
 
 		 610 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 597 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 		 649 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.82 
 
 		 601 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 600 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 620 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  21.98 
 
 		 610 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  23.23 
 
 		 592 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  22.62 
 
 		 559 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  22.24 
 
 		 607 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  27.66 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  24.69 
 
 		 1549 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 		 505 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  21.86 
 
 		 598 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>