More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4165 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 627 aa  1263    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  66.67 
 
 		 626 aa  833    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  67.19 
 
 		 631 aa  877    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  40.44 
 
 		 624 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  40.13 
 
 		 624 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  40.03 
 
 		 618 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  40.44 
 
 		 624 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  41.13 
 
 		 622 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  39.46 
 
 		 618 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  40.36 
 
 		 620 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  40.36 
 
 		 625 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  40.17 
 
 		 617 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  39.55 
 
 		 626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  39.19 
 
 		 627 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  38.85 
 
 		 628 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  39.64 
 
 		 648 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  40.88 
 
 		 589 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  39.83 
 
 		 589 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  38.6 
 
 		 633 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  37.58 
 
 		 635 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  38.56 
 
 		 630 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  38.73 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  37.01 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  39.19 
 
 		 633 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 		 606 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  39.19 
 
 		 633 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  37.34 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  40.22 
 
 		 632 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  39.84 
 
 		 626 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  36.76 
 
 		 631 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  38.28 
 
 		 633 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  37.56 
 
 		 624 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  34.04 
 
 		 617 aa  388  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  37.01 
 
 		 618 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  39.5 
 
 		 631 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  38.01 
 
 		 617 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  36.45 
 
 		 640 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  39.42 
 
 		 671 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  36.81 
 
 		 619 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  37.56 
 
 		 629 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  35.59 
 
 		 643 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  36.26 
 
 		 599 aa  362  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  34.63 
 
 		 619 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  38.83 
 
 		 618 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  38.83 
 
 		 618 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  37.48 
 
 		 619 aa  355  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  38.58 
 
 		 605 aa  349  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  37.8 
 
 		 611 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  36.39 
 
 		 603 aa  340  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  34.74 
 
 		 573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  41.57 
 
 		 279 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 		 560 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.71 
 
 		 590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 609 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  23.58 
 
 		 602 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 551 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.92 
 
 		 602 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.6 
 
 		 601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  25.16 
 
 		 555 aa  111  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  23.44 
 
 		 551 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  24.52 
 
 		 610 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  24.26 
 
 		 551 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 		 617 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 		 630 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 592 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  24.71 
 
 		 633 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 1549 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  24.3 
 
 		 587 aa  103  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 		 597 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  25.77 
 
 		 567 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  24.45 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  25.79 
 
 		 601 aa  102  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  24.37 
 
 		 554 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  24.37 
 
 		 554 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  22.05 
 
 		 551 aa  101  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  23.92 
 
 		 604 aa  101  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  24.77 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  24.32 
 
 		 554 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 		 554 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  24.37 
 
 		 554 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  24.26 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  29.68 
 
 		 480 aa  99.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  24.09 
 
 		 601 aa  98.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  23.3 
 
 		 591 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  24.14 
 
 		 622 aa  99  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  24.31 
 
 		 598 aa  98.6  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  24.09 
 
 		 601 aa  98.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  25.32 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 		 652 aa  98.2  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 564 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  24.06 
 
 		 645 aa  97.8  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  27.31 
 
 		 532 aa  97.8  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  22.52 
 
 		 590 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  23.95 
 
 		 602 aa  97.8  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 511 aa  97.8  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 620 aa  97.4  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  26.39 
 
 		 706 aa  97.4  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 		 603 aa  97.4  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>