More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6831 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 643 aa  1306    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  45.36 
 
 		 619 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  44.68 
 
 		 609 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  44.92 
 
 		 630 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  44.43 
 
 		 635 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  44.46 
 
 		 606 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  43.8 
 
 		 631 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  45.36 
 
 		 619 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  45.75 
 
 		 626 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  45.41 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  44.41 
 
 		 618 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  44.35 
 
 		 617 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  44.66 
 
 		 626 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  46.27 
 
 		 671 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  45.81 
 
 		 589 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  43.98 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  45.64 
 
 		 648 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  37.91 
 
 		 617 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  45.1 
 
 		 627 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  43.87 
 
 		 589 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  45.75 
 
 		 633 aa  482  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  44.78 
 
 		 630 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  45.25 
 
 		 611 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  43.7 
 
 		 640 aa  475  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  44.95 
 
 		 635 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  42.32 
 
 		 617 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  43.65 
 
 		 628 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  42.26 
 
 		 625 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  44.26 
 
 		 633 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  44.26 
 
 		 633 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  43.34 
 
 		 632 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  40.6 
 
 		 618 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  41.79 
 
 		 624 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  44.55 
 
 		 618 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  39.93 
 
 		 599 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  44.55 
 
 		 618 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  39.8 
 
 		 624 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  40.13 
 
 		 624 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  40.29 
 
 		 622 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  37.89 
 
 		 618 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  40.84 
 
 		 631 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  38.01 
 
 		 573 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  40.51 
 
 		 605 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  38.39 
 
 		 620 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  37.6 
 
 		 619 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  37.46 
 
 		 631 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  35.59 
 
 		 627 aa  362  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  36.36 
 
 		 629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  36.08 
 
 		 626 aa  347  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  35.21 
 
 		 603 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  43.12 
 
 		 279 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  23.44 
 
 		 592 aa  127  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 633 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 630 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.8 
 
 		 606 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  22.57 
 
 		 607 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.21 
 
 		 610 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  21.65 
 
 		 590 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  21.48 
 
 		 587 aa  110  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  23.82 
 
 		 598 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.52 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  24.72 
 
 		 612 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  23.3 
 
 		 610 aa  107  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  24.12 
 
 		 633 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  22.83 
 
 		 597 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 617 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  22.03 
 
 		 610 aa  104  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  23.4 
 
 		 602 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 903 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  22.5 
 
 		 598 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  23.26 
 
 		 597 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  22.79 
 
 		 598 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  24.63 
 
 		 602 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  24.71 
 
 		 613 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  20.44 
 
 		 609 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  23.65 
 
 		 601 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 647 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  23.26 
 
 		 597 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 		 606 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 		 606 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  23.26 
 
 		 597 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  21.47 
 
 		 592 aa  99.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1468  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.5 
 
 		 563 aa  98.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  23.88 
 
 		 597 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.53 
 
 		 562 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  23.55 
 
 		 630 aa  97.8  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 606 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  22.45 
 
 		 610 aa  97.8  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  22.56 
 
 		 598 aa  97.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 		 566 aa  97.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  24.03 
 
 		 612 aa  97.1  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.15 
 
 		 553 aa  96.3  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.176827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  21.83 
 
 		 601 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.71 
 
 		 602 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  21.75 
 
 		 596 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  21.67 
 
 		 601 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  23.33 
 
 		 597 aa  95.5  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  21.67 
 
 		 601 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.39 
 
 		 601 aa  95.5  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>