More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3634 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 560 aa  1093    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  30.33 
 
 		 633 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  30.95 
 
 		 619 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  32.62 
 
 		 624 aa  236  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  31.77 
 
 		 635 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  31.03 
 
 		 630 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  29.26 
 
 		 617 aa  230  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  31.12 
 
 		 648 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  29.92 
 
 		 619 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  31.12 
 
 		 589 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  29.69 
 
 		 589 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  31.24 
 
 		 617 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  30.37 
 
 		 618 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  30.52 
 
 		 631 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  30.64 
 
 		 627 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  31.6 
 
 		 626 aa  223  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 606 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  32.85 
 
 		 640 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  30.13 
 
 		 609 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  31.51 
 
 		 628 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  31.42 
 
 		 633 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  31.11 
 
 		 635 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  31.42 
 
 		 633 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  31.91 
 
 		 630 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  31.72 
 
 		 633 aa  207  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  29.3 
 
 		 643 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  30.46 
 
 		 632 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  32.2 
 
 		 573 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  30.7 
 
 		 626 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  31 
 
 		 617 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  34.45 
 
 		 618 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  34.45 
 
 		 618 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  31.28 
 
 		 671 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  30.54 
 
 		 618 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  29.45 
 
 		 619 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  31.16 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  28.68 
 
 		 599 aa  181  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  29.03 
 
 		 629 aa  180  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 631 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 605 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  30.92 
 
 		 625 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  30.31 
 
 		 603 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  27.42 
 
 		 620 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  28.05 
 
 		 618 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  30.98 
 
 		 626 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  29.18 
 
 		 627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  29.07 
 
 		 631 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  26.35 
 
 		 624 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  25.42 
 
 		 624 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  29.22 
 
 		 624 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  33.71 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  26.82 
 
 		 622 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  28.4 
 
 		 512 aa  104  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  27.9 
 
 		 510 aa  93.6  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  25.73 
 
 		 508 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  27.47 
 
 		 506 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 610 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  25.44 
 
 		 505 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  25.45 
 
 		 504 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  28.3 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  24.56 
 
 		 604 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  26.27 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  29.62 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  27.25 
 
 		 526 aa  83.6  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.7 
 
 		 500 aa  82.8  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3491  acyl-CoA synthetase  31.21 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  28.21 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  26.85 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1437  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 1460 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  27.29 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2510  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 1549 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  25.53 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1256  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.775315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  24.44 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2423  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 1549 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  23.94 
 
 		 493 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  25 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  23.71 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 553 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  26.7 
 
 		 555 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  26.11 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.74 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  29.42 
 
 		 5698 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.74 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  26.48 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.74 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  26.94 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  26.7 
 
 		 555 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 		 501 aa  77.4  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  26.92 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  28.21 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  25.42 
 
 		 522 aa  77  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6317  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  23.7 
 
 		 579 aa  77  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  26.37 
 
 		 517 aa  76.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7005  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 		 523 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>