More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1560 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 606 aa  1249    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  51.6 
 
 		 626 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  50.76 
 
 		 640 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  48.93 
 
 		 619 aa  589  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  49.58 
 
 		 626 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  49.17 
 
 		 618 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  47.94 
 
 		 631 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  48.93 
 
 		 619 aa  581  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  48.18 
 
 		 617 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  48.6 
 
 		 633 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  47.52 
 
 		 648 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  47.1 
 
 		 609 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  48.01 
 
 		 630 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  48.7 
 
 		 589 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  46 
 
 		 627 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  46.37 
 
 		 635 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  47.61 
 
 		 630 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  47.24 
 
 		 617 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  47.61 
 
 		 635 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  47.46 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  46.5 
 
 		 624 aa  548  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  47.57 
 
 		 618 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  47.95 
 
 		 633 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  48.12 
 
 		 628 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  47.95 
 
 		 633 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  47.57 
 
 		 618 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  43.83 
 
 		 633 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  44.46 
 
 		 643 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  45.42 
 
 		 589 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  44.61 
 
 		 618 aa  528  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  47.19 
 
 		 632 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  46.21 
 
 		 617 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  45.44 
 
 		 625 aa  512  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  41.95 
 
 		 599 aa  485  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  44.15 
 
 		 611 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  42.79 
 
 		 624 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  41.68 
 
 		 618 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  42.29 
 
 		 624 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  42.12 
 
 		 624 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  42.56 
 
 		 619 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  42.79 
 
 		 605 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  43.05 
 
 		 622 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  41.69 
 
 		 620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  39.6 
 
 		 629 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  41.09 
 
 		 631 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  37.85 
 
 		 631 aa  415  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  38.76 
 
 		 627 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  39.79 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  40.31 
 
 		 626 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  36.6 
 
 		 603 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  49.06 
 
 		 279 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 560 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  24.7 
 
 		 592 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.1 
 
 		 590 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.67 
 
 		 610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  24.22 
 
 		 633 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 617 aa  124  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  23.39 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.96 
 
 		 610 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  24.63 
 
 		 605 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  24.44 
 
 		 612 aa  117  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  21.37 
 
 		 587 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  23.53 
 
 		 604 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  22.56 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  22.77 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  22.24 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  22.34 
 
 		 555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  27.27 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 		 606 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 630 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  23.08 
 
 		 663 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  24.81 
 
 		 607 aa  110  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  22.97 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  24.59 
 
 		 607 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  24.39 
 
 		 609 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  25.94 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  23.47 
 
 		 616 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  27.08 
 
 		 508 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  23.67 
 
 		 551 aa  107  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  23.3 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  23.95 
 
 		 620 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  24.38 
 
 		 622 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  23.27 
 
 		 599 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  23.38 
 
 		 612 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  24.85 
 
 		 566 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  22.65 
 
 		 601 aa  105  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  24.89 
 
 		 551 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 620 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  23.27 
 
 		 592 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  23.9 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  22.35 
 
 		 590 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  22.22 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  24.76 
 
 		 615 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  24.91 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  23.36 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 508 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  23.41 
 
 		 597 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>