More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42140 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  52.48 
 
 		 599 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 619 aa  1263    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  53.19 
 
 		 605 aa  594  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  48.64 
 
 		 617 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  45.28 
 
 		 625 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  44.58 
 
 		 631 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  42.08 
 
 		 624 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  42.74 
 
 		 624 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  40.64 
 
 		 618 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  42.46 
 
 		 626 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  43.05 
 
 		 622 aa  442  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  42.56 
 
 		 606 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  42.24 
 
 		 624 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  40.26 
 
 		 635 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  39.9 
 
 		 671 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  40.83 
 
 		 630 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  40.26 
 
 		 573 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  39.02 
 
 		 617 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  41.2 
 
 		 630 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  41.36 
 
 		 635 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  39.9 
 
 		 617 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  40 
 
 		 609 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  40.36 
 
 		 633 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  39.47 
 
 		 618 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  38.03 
 
 		 619 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  40.31 
 
 		 640 aa  422  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  38.63 
 
 		 631 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  41.5 
 
 		 628 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  38.63 
 
 		 619 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  41.33 
 
 		 633 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  41.33 
 
 		 633 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  39.5 
 
 		 632 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  41.9 
 
 		 626 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  41.15 
 
 		 589 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  39.48 
 
 		 624 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  40.2 
 
 		 633 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  39.39 
 
 		 627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  41.51 
 
 		 611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  42.1 
 
 		 618 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  39.74 
 
 		 620 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  41.14 
 
 		 648 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  42.1 
 
 		 618 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  39.51 
 
 		 589 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  38.16 
 
 		 618 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  37.6 
 
 		 643 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  38.16 
 
 		 629 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  37.83 
 
 		 603 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  39.3 
 
 		 626 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  38.36 
 
 		 631 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  37.48 
 
 		 627 aa  355  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  40.7 
 
 		 279 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 		 590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.87 
 
 		 592 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 		 612 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  25.75 
 
 		 633 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  30.5 
 
 		 480 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  25.53 
 
 		 603 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  25.73 
 
 		 601 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  25.82 
 
 		 606 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.64 
 
 		 610 aa  108  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 502 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  22.86 
 
 		 587 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 620 aa  107  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  24.63 
 
 		 600 aa  107  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  21.88 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 501 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 622 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.13 
 
 		 606 aa  104  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  23.98 
 
 		 607 aa  104  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 616 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  24.22 
 
 		 603 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  26.53 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.84 
 
 		 597 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  25.57 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  22.71 
 
 		 602 aa  102  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  23.53 
 
 		 551 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 592 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  31.76 
 
 		 503 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 630 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  25.62 
 
 		 602 aa  101  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 507 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  26.75 
 
 		 530 aa  101  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 		 607 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.51 
 
 		 601 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.83 
 
 		 610 aa  100  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  24.69 
 
 		 607 aa  100  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 606 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  23.21 
 
 		 637 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 		 605 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  25.52 
 
 		 612 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  23.68 
 
 		 603 aa  99.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  24.75 
 
 		 701 aa  98.6  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  25.2 
 
 		 601 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  23.18 
 
 		 610 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  22.09 
 
 		 551 aa  98.6  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>