More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2726 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  79.35 
 
 		 589 aa  950    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  60.46 
 
 		 624 aa  748    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  60.7 
 
 		 640 aa  730    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  58.69 
 
 		 633 aa  718    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  93.68 
 
 		 589 aa  1133    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  56.1 
 
 		 626 aa  684    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 633 aa  1298    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  60.26 
 
 		 671 aa  744    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  58.35 
 
 		 618 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  76.87 
 
 		 648 aa  979    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  58.12 
 
 		 632 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  55.07 
 
 		 617 aa  665    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  53.54 
 
 		 619 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  58.35 
 
 		 618 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  58.4 
 
 		 630 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  78.49 
 
 		 627 aa  981    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  58.1 
 
 		 628 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  58.89 
 
 		 633 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  57.89 
 
 		 635 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  65.84 
 
 		 626 aa  824    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  58.89 
 
 		 633 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  50.83 
 
 		 619 aa  634  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  51.07 
 
 		 618 aa  624  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  48.84 
 
 		 630 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  46.22 
 
 		 617 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  48.26 
 
 		 635 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  47.6 
 
 		 631 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  47.5 
 
 		 609 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  43.83 
 
 		 606 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  43.98 
 
 		 643 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  45.1 
 
 		 611 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  44.77 
 
 		 625 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  44.3 
 
 		 617 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  41.67 
 
 		 618 aa  465  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  41.41 
 
 		 624 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  41.9 
 
 		 624 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  41.96 
 
 		 622 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  39.9 
 
 		 599 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  39.26 
 
 		 618 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  41.12 
 
 		 624 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  40.2 
 
 		 619 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  43.19 
 
 		 605 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  38.6 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 		 631 aa  405  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  37.32 
 
 		 631 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  39.59 
 
 		 629 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  36.74 
 
 		 573 aa  363  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  37.48 
 
 		 626 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  37.01 
 
 		 620 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  35.74 
 
 		 603 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  64.42 
 
 		 279 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0835  feruloyl-CoA synthetase  48.04 
 
 		 312 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  24.57 
 
 		 630 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  23.26 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  24.89 
 
 		 633 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  22.67 
 
 		 590 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  22.84 
 
 		 679 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  23.71 
 
 		 592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  21.84 
 
 		 604 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2423  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 		 1549 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 606 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2510  AMP-dependent synthetase and ligase  26.3 
 
 		 1549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  22.43 
 
 		 592 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 		 606 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1437  AMP-dependent synthetase and ligase  25.99 
 
 		 1460 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  23.28 
 
 		 592 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  21.54 
 
 		 610 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  22.08 
 
 		 702 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 606 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  22.26 
 
 		 596 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  21.82 
 
 		 607 aa  108  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 1549 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 		 567 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  24.7 
 
 		 610 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  22.67 
 
 		 598 aa  104  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  22.37 
 
 		 598 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  20.89 
 
 		 607 aa  103  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  24.7 
 
 		 622 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.07 
 
 		 562 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  21.82 
 
 		 606 aa  101  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  21.73 
 
 		 610 aa  101  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 		 566 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  22.58 
 
 		 590 aa  99.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  22.35 
 
 		 598 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  24.47 
 
 		 607 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  24.79 
 
 		 558 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  24.46 
 
 		 600 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 		 887 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 		 608 aa  98.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  23.83 
 
 		 569 aa  98.2  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  20.9 
 
 		 601 aa  98.2  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  24.63 
 
 		 569 aa  97.4  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.14 
 
 		 563 aa  97.4  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.77 
 
 		 558 aa  97.4  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  21.69 
 
 		 602 aa  97.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0222  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  24.17 
 
 		 569 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  23.33 
 
 		 649 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  21.67 
 
 		 555 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>