More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4595 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  59.08 
 
 		 589 aa  687    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  62.9 
 
 		 624 aa  756    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  56.93 
 
 		 627 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  59.08 
 
 		 589 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 628 aa  1269    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  58.1 
 
 		 633 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  66.78 
 
 		 671 aa  801    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  56.84 
 
 		 648 aa  696    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  55.15 
 
 		 626 aa  658    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  75.94 
 
 		 618 aa  886    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  90.32 
 
 		 632 aa  1099    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  67.32 
 
 		 633 aa  850    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  94.44 
 
 		 630 aa  1183    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  98.69 
 
 		 633 aa  1220    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  58.6 
 
 		 626 aa  695    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  75.78 
 
 		 618 aa  884    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  93.49 
 
 		 635 aa  1173    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  98.69 
 
 		 633 aa  1220    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  70.23 
 
 		 640 aa  856    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  51.4 
 
 		 617 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  49.42 
 
 		 619 aa  591  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  48.02 
 
 		 618 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  49.59 
 
 		 619 aa  575  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  49.25 
 
 		 630 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  48.12 
 
 		 606 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  48.74 
 
 		 635 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  47.09 
 
 		 609 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  48.49 
 
 		 631 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  43.84 
 
 		 617 aa  515  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  47.99 
 
 		 617 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  44.33 
 
 		 618 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  43.65 
 
 		 643 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  43.52 
 
 		 625 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  43 
 
 		 624 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  78.49 
 
 		 279 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  43.89 
 
 		 624 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  42.2 
 
 		 599 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  42.86 
 
 		 618 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  43.39 
 
 		 624 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  45.55 
 
 		 611 aa  438  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  44.69 
 
 		 631 aa  439  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  43.67 
 
 		 622 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  41.5 
 
 		 619 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  43.7 
 
 		 605 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  39.02 
 
 		 627 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  41.03 
 
 		 631 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  38.92 
 
 		 620 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  38.46 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  40.64 
 
 		 629 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  39.11 
 
 		 603 aa  364  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  36.82 
 
 		 626 aa  359  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0835  feruloyl-CoA synthetase  70.11 
 
 		 312 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  26.2 
 
 		 630 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  25.39 
 
 		 622 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  24.38 
 
 		 592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 		 606 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 		 606 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.95 
 
 		 590 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  26.14 
 
 		 617 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  26.17 
 
 		 607 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  22.84 
 
 		 592 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.5 
 
 		 557 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.65 
 
 		 557 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.5 
 
 		 557 aa  113  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  22.88 
 
 		 633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 		 557 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.03 
 
 		 557 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.92 
 
 		 557 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.65 
 
 		 557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  21.11 
 
 		 610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  24.01 
 
 		 609 aa  112  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  23.5 
 
 		 610 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.29 
 
 		 557 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.88 
 
 		 558 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.5 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.21 
 
 		 562 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  23.21 
 
 		 607 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.14 
 
 		 557 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.86 
 
 		 601 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  24.35 
 
 		 613 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  24.01 
 
 		 609 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 903 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  23.64 
 
 		 633 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  25.45 
 
 		 569 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  21.86 
 
 		 587 aa  106  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.61 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 		 583 aa  104  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.54 
 
 		 583 aa  104  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.54 
 
 		 561 aa  104  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  26.54 
 
 		 561 aa  104  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.54 
 
 		 561 aa  104  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.54 
 
 		 561 aa  104  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.54 
 
 		 561 aa  104  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  26.54 
 
 		 561 aa  104  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.9 
 
 		 572 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.62 
 
 		 557 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>