More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2125 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 631 aa  1245    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  50.24 
 
 		 617 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  43.94 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  45.45 
 
 		 619 aa  495  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  46.84 
 
 		 605 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  44.83 
 
 		 631 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  45.32 
 
 		 609 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  45.6 
 
 		 630 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  46.24 
 
 		 625 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  43.72 
 
 		 599 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  44.07 
 
 		 635 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  43.89 
 
 		 624 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  46.03 
 
 		 626 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  44.21 
 
 		 624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  46.71 
 
 		 630 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  43.43 
 
 		 624 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  46.71 
 
 		 635 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  44.69 
 
 		 624 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  46.61 
 
 		 628 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  47.05 
 
 		 633 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  47.05 
 
 		 633 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  44.05 
 
 		 622 aa  452  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  44.63 
 
 		 627 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  45.77 
 
 		 640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  44.3 
 
 		 671 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  44.01 
 
 		 648 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  44.37 
 
 		 619 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  42.62 
 
 		 606 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  42.6 
 
 		 629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  44.56 
 
 		 589 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  43.24 
 
 		 619 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  43.85 
 
 		 617 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  43.86 
 
 		 633 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  45.7 
 
 		 632 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  42.29 
 
 		 618 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  42.6 
 
 		 618 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  39.56 
 
 		 617 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  44 
 
 		 620 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  44.63 
 
 		 626 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  42.03 
 
 		 643 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  43.12 
 
 		 589 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  41.63 
 
 		 633 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  42.06 
 
 		 631 aa  419  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  41.51 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  40.48 
 
 		 627 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  43.34 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  43.34 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  38.66 
 
 		 603 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  42.56 
 
 		 611 aa  385  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  40 
 
 		 626 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 560 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  41.24 
 
 		 279 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  24.88 
 
 		 604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  30.4 
 
 		 510 aa  107  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  30.64 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  29.74 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  22.96 
 
 		 590 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 612 aa  104  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  31.89 
 
 		 506 aa  103  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 		 616 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  30.82 
 
 		 503 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 609 aa  101  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  29.61 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  24.6 
 
 		 663 aa  100  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  26.4 
 
 		 508 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  24.42 
 
 		 551 aa  99.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  22.87 
 
 		 587 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  24.38 
 
 		 701 aa  99  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  27.37 
 
 		 510 aa  97.8  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  29.36 
 
 		 564 aa  97.4  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 555 aa  97.8  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  26.21 
 
 		 606 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 606 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 609 aa  95.9  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  27.19 
 
 		 511 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  32.54 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  30.43 
 
 		 507 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  24.42 
 
 		 551 aa  95.9  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  23.67 
 
 		 555 aa  95.1  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  27.29 
 
 		 504 aa  95.1  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  27.64 
 
 		 505 aa  95.1  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 		 569 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  26.88 
 
 		 503 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  30.69 
 
 		 504 aa  94  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 553 aa  94  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  24.25 
 
 		 597 aa  94  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  28.31 
 
 		 469 aa  93.6  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 568 aa  93.6  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.240811  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  29.78 
 
 		 509 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  26.71 
 
 		 647 aa  93.2  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  31.39 
 
 		 504 aa  93.2  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  24.09 
 
 		 597 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09216  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 		 567 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945488  normal  0.813048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  26.55 
 
 		 566 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 825 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  30.41 
 
 		 557 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  29.52 
 
 		 509 aa  92  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>