More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1204 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 568 aa  1166    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.240811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  36.32 
 
 		 591 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 553 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 590 aa  352  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2155  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 594 aa  350  3e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1867  long-chain fatty acid CoA ligase (AMP-binding)  36.52 
 
 		 575 aa  350  4e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.805578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2156  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 575 aa  350  5e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 588 aa  347  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.23 
 
 		 561 aa  346  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1866  long-chain fatty acid-CoA ligase (AMP-binding)  37.1 
 
 		 594 aa  346  8e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.93 
 
 		 561 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 		 552 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.13 
 
 		 582 aa  343  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 572 aa  343  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 577 aa  343  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 		 563 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 		 563 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  35.15 
 
 		 569 aa  342  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 566 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.33 
 
 		 560 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01137  acyl-CoA synthetase (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), acyl-adenylate activating enzyme  38.11 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00114592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.52 
 
 		 561 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 		 563 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 		 563 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.65 
 
 		 560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.44 
 
 		 557 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.94 
 
 		 557 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.94 
 
 		 557 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.61 
 
 		 557 aa  339  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.94 
 
 		 557 aa  339  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  35.48 
 
 		 560 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  34.73 
 
 		 569 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 565 aa  338  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 		 561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 564 aa  335  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.81 
 
 		 581 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.27 
 
 		 557 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 558 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.81 
 
 		 554 aa  335  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.29 
 
 		 561 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1495  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 		 562 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2193  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 576 aa  333  5e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.08 
 
 		 561 aa  333  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.75 
 
 		 557 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.49 
 
 		 557 aa  332  9e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 583 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.13 
 
 		 583 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 		 572 aa  332  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  36.08 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 579 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.08 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.08 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1667  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.55 
 
 		 573 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.08 
 
 		 561 aa  332  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  36.08 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.08 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.7 
 
 		 581 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 569 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.47 
 
 		 561 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 562 aa  329  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.556582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.1 
 
 		 563 aa  329  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.84 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.64 
 
 		 561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4098  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.49 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.6 
 
 		 567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 564 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 579 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 569 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.84 
 
 		 557 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1824  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.31 
 
 		 562 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.919675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.89 
 
 		 557 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.55 
 
 		 557 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.56 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.55 
 
 		 557 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 562 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0474  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.72 
 
 		 557 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 561 aa  324  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 566 aa  324  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3836  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.32 
 
 		 562 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 		 569 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.48 
 
 		 569 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0069  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 647 aa  323  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 584 aa  323  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 567 aa  322  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3482  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.84 
 
 		 557 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194948  hitchhiker  0.00229302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.85 
 
 		 562 aa  322  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.95 
 
 		 572 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0516  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 561 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0152867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 562 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0770506  normal  0.73273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.13 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 551 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.82 
 
 		 569 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.09 
 
 		 555 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0532  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 561 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3653  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 578 aa  320  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>