More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3240 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  57 
 
 		 605 aa  687    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 599 aa  1232    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  52.48 
 
 		 619 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  45.94 
 
 		 617 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  46.31 
 
 		 625 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  43.34 
 
 		 626 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 		 606 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  41.28 
 
 		 617 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  42.2 
 
 		 631 aa  452  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  42.56 
 
 		 624 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  42.26 
 
 		 635 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  42.06 
 
 		 630 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  42.41 
 
 		 630 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  41.64 
 
 		 619 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  41.43 
 
 		 633 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  41.72 
 
 		 635 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  41.43 
 
 		 633 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  40.2 
 
 		 609 aa  439  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  41.6 
 
 		 628 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  41.82 
 
 		 624 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  41.13 
 
 		 624 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  41.32 
 
 		 618 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  40.73 
 
 		 626 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  42.01 
 
 		 631 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  42.06 
 
 		 640 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  38.94 
 
 		 618 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  41.18 
 
 		 619 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  39.93 
 
 		 643 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  41.71 
 
 		 589 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  40.88 
 
 		 632 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  41.71 
 
 		 648 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  41.59 
 
 		 617 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  42.11 
 
 		 622 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  42.25 
 
 		 618 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  42.25 
 
 		 618 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  39.9 
 
 		 633 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  40.87 
 
 		 633 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  41.4 
 
 		 671 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  40.49 
 
 		 627 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  40.48 
 
 		 589 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  41.22 
 
 		 624 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  39.1 
 
 		 573 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  37.75 
 
 		 618 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  39.46 
 
 		 603 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  39.59 
 
 		 611 aa  399  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  39.06 
 
 		 620 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  36.77 
 
 		 629 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  36.76 
 
 		 631 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  36.26 
 
 		 627 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  35.64 
 
 		 626 aa  346  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  44.09 
 
 		 279 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 560 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  22.95 
 
 		 590 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  23.9 
 
 		 551 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.3 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.73 
 
 		 557 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  27.88 
 
 		 510 aa  107  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.42 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02674  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14270)  28.5 
 
 		 554 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  27.31 
 
 		 542 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.42 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 		 507 aa  104  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.15 
 
 		 557 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  24.26 
 
 		 607 aa  103  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.28 
 
 		 557 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.18 
 
 		 555 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.28 
 
 		 557 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  23.57 
 
 		 551 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  24.32 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  23.55 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  23.73 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.71 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  26.85 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.73 
 
 		 557 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.88 
 
 		 557 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  31.34 
 
 		 503 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 		 602 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  25.3 
 
 		 546 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 		 602 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26 
 
 		 566 aa  101  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 551 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.27 
 
 		 557 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.36 
 
 		 557 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.35 
 
 		 557 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  24.07 
 
 		 566 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.17 
 
 		 562 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.59 
 
 		 557 aa  100  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.63 
 
 		 563 aa  100  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  24.4 
 
 		 592 aa  100  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  25.18 
 
 		 508 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 602 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  25.31 
 
 		 508 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 558 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.71 
 
 		 563 aa  98.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 507 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  24.8 
 
 		 610 aa  98.6  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.17 
 
 		 562 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.43 
 
 		 557 aa  97.8  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  26.43 
 
 		 504 aa  98.2  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>