More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2723 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  66.67 
 
 		 627 aa  847    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 626 aa  1266    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  62.44 
 
 		 631 aa  800    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  42.79 
 
 		 624 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  40.98 
 
 		 618 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  42.16 
 
 		 624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  40.19 
 
 		 618 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  41.88 
 
 		 624 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  40.13 
 
 		 620 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  41.87 
 
 		 622 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  39.7 
 
 		 625 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 606 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  37.42 
 
 		 635 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  37.3 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  37.14 
 
 		 609 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  37.38 
 
 		 631 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  38.41 
 
 		 617 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  39.46 
 
 		 619 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  41.52 
 
 		 589 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  40.84 
 
 		 626 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  40.39 
 
 		 627 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  39.6 
 
 		 631 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  41.52 
 
 		 648 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  33.44 
 
 		 617 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  38.52 
 
 		 603 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  39.44 
 
 		 589 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  37.62 
 
 		 633 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  36.01 
 
 		 640 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  36.41 
 
 		 629 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  39.37 
 
 		 611 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  37.89 
 
 		 626 aa  362  9e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  36.76 
 
 		 630 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  38.85 
 
 		 605 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  36.99 
 
 		 628 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  36.42 
 
 		 635 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  37.23 
 
 		 633 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  37.23 
 
 		 633 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  36.08 
 
 		 643 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  37.07 
 
 		 624 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  38.38 
 
 		 633 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  35.81 
 
 		 599 aa  353  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  35.86 
 
 		 617 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  36.73 
 
 		 671 aa  346  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  38.04 
 
 		 618 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  39.38 
 
 		 618 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  37.27 
 
 		 632 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  39.38 
 
 		 618 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  34.63 
 
 		 619 aa  332  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  35.33 
 
 		 619 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  36.39 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  38.11 
 
 		 279 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 567 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 		 590 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  25.41 
 
 		 555 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.85 
 
 		 601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.56 
 
 		 603 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  22.52 
 
 		 602 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 630 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  24.88 
 
 		 609 aa  104  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  25.97 
 
 		 592 aa  104  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  25.32 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  23.62 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.12 
 
 		 516 aa  101  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  24 
 
 		 551 aa  101  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  21.96 
 
 		 599 aa  101  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 		 812 aa  99.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.04 
 
 		 602 aa  99.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  23.48 
 
 		 633 aa  98.2  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 		 597 aa  97.8  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  22.74 
 
 		 551 aa  97.8  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  21.45 
 
 		 607 aa  97.4  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  24.39 
 
 		 552 aa  97.4  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  24.88 
 
 		 597 aa  97.1  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  22.38 
 
 		 598 aa  96.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  22.9 
 
 		 592 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  21.57 
 
 		 598 aa  96.3  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  23.14 
 
 		 555 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 		 620 aa  96.3  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  22.54 
 
 		 611 aa  95.5  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 		 511 aa  95.5  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 612 aa  94.7  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  23.86 
 
 		 554 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  23.86 
 
 		 554 aa  94.4  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  24.24 
 
 		 597 aa  94.4  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  23.86 
 
 		 554 aa  94  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 605 aa  93.6  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  23.44 
 
 		 554 aa  93.6  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  23.27 
 
 		 575 aa  93.6  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 617 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  23.24 
 
 		 554 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 903 aa  93.2  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 824 aa  93.2  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  24.35 
 
 		 601 aa  93.2  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  25.6 
 
 		 546 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  24.12 
 
 		 578 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  27.97 
 
 		 531 aa  92.8  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  22.96 
 
 		 598 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  23.75 
 
 		 604 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>