More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0285 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 611 aa  1246    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  48.52 
 
 		 635 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  48.17 
 
 		 630 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  47.92 
 
 		 609 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  44.58 
 
 		 617 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  47.13 
 
 		 631 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  46.31 
 
 		 627 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  45.63 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  45.15 
 
 		 589 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  44.98 
 
 		 626 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  44.15 
 
 		 606 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  46.56 
 
 		 589 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  46.38 
 
 		 648 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  45.25 
 
 		 643 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  44.59 
 
 		 617 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  45.82 
 
 		 625 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  43.46 
 
 		 618 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  44.79 
 
 		 626 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  43.19 
 
 		 619 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  42.13 
 
 		 619 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  46.92 
 
 		 640 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  44.93 
 
 		 617 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  44.44 
 
 		 624 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  45.71 
 
 		 671 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  41.87 
 
 		 618 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  45.65 
 
 		 618 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  45.55 
 
 		 628 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  45.65 
 
 		 618 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  45.55 
 
 		 633 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  45.84 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  45.55 
 
 		 633 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  44.27 
 
 		 633 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  45.05 
 
 		 630 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  44.78 
 
 		 624 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  43.61 
 
 		 624 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  44.99 
 
 		 632 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  44.35 
 
 		 622 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  43.79 
 
 		 624 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  41.51 
 
 		 619 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  40.38 
 
 		 618 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  39.59 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  39.79 
 
 		 629 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  41.25 
 
 		 605 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  39.96 
 
 		 631 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  41.65 
 
 		 631 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  37.26 
 
 		 620 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  40.03 
 
 		 603 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  39.04 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  39.79 
 
 		 573 aa  355  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  37.98 
 
 		 627 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  42.86 
 
 		 279 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  25.99 
 
 		 600 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  25.63 
 
 		 620 aa  125  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  25.26 
 
 		 592 aa  124  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.48 
 
 		 590 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  25.58 
 
 		 633 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  25.59 
 
 		 606 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  21.63 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  24.23 
 
 		 604 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  25.28 
 
 		 606 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 607 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  22.33 
 
 		 598 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  21.83 
 
 		 597 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.69 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 		 606 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  24.8 
 
 		 701 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  23.22 
 
 		 607 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  26.52 
 
 		 599 aa  107  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  20.55 
 
 		 607 aa  107  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  21.89 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  22.98 
 
 		 598 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  23.73 
 
 		 616 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  23.75 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  22.26 
 
 		 611 aa  104  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 527 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.1 
 
 		 614 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  24.12 
 
 		 630 aa  104  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.56 
 
 		 601 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  23.24 
 
 		 605 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 505 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  22.14 
 
 		 610 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  23.21 
 
 		 597 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  22.35 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  22.24 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  21.5 
 
 		 598 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  22.18 
 
 		 601 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  28.37 
 
 		 516 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  23.71 
 
 		 647 aa  101  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  21.81 
 
 		 596 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  22.04 
 
 		 558 aa  101  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 508 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  23.32 
 
 		 599 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.01 
 
 		 937 aa  100  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  21.26 
 
 		 592 aa  100  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  24.67 
 
 		 567 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  22.91 
 
 		 601 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  22.18 
 
 		 601 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>