More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0834 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  99.28 
 
 		 618 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  100 
 
 		 279 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  98.92 
 
 		 618 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  78.49 
 
 		 630 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  77.42 
 
 		 635 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  78.49 
 
 		 633 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  78.49 
 
 		 633 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  78.49 
 
 		 628 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  77.42 
 
 		 632 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  68.93 
 
 		 633 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  71.32 
 
 		 640 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  70.04 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  64 
 
 		 589 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  66.67 
 
 		 626 aa  358  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  65.17 
 
 		 648 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  66.04 
 
 		 671 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  64.04 
 
 		 589 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  64.42 
 
 		 633 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  60.93 
 
 		 627 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  58.51 
 
 		 626 aa  328  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  50.19 
 
 		 617 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  50.56 
 
 		 619 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  49.06 
 
 		 606 aa  269  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  49.44 
 
 		 618 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  50.19 
 
 		 619 aa  264  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  45.49 
 
 		 617 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  45.65 
 
 		 617 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  43.73 
 
 		 625 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  45.42 
 
 		 609 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  46.44 
 
 		 630 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  45.65 
 
 		 635 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  45.05 
 
 		 618 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  44.09 
 
 		 599 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  42.49 
 
 		 618 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  46.59 
 
 		 631 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  46.42 
 
 		 605 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  44.44 
 
 		 624 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  43.73 
 
 		 624 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  43.8 
 
 		 622 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  41.94 
 
 		 624 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  43.12 
 
 		 643 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  40.7 
 
 		 619 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  41.57 
 
 		 627 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  41.67 
 
 		 629 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  40.14 
 
 		 620 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  39.41 
 
 		 631 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  40.7 
 
 		 603 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  41.43 
 
 		 611 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  37.83 
 
 		 573 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  38.11 
 
 		 626 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  41.94 
 
 		 631 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 560 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 630 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 609 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 609 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 633 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  31.49 
 
 		 607 aa  87.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 620 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 633 aa  85.5  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  25.73 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  25.82 
 
 		 607 aa  82.8  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.1 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 597 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 598 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 597 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 613 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 616 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 597 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 		 601 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 		 601 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 606 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 601 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  27.39 
 
 		 568 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 601 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 597 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 606 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 592 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 		 598 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  27 
 
 		 679 aa  77.8  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  24.38 
 
 		 601 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 597 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  25.94 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 602 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 606 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 615 aa  77  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.31 
 
 		 601 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 632 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.92 
 
 		 614 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  24.7 
 
 		 649 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  27.31 
 
 		 602 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  27.31 
 
 		 602 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.73 
 
 		 598 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  27.31 
 
 		 602 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  24.49 
 
 		 602 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 		 649 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  25.94 
 
 		 597 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 590 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 601 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>