More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7092 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  72.28 
 
 		 630 aa  915    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  71.78 
 
 		 635 aa  912    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  72.77 
 
 		 631 aa  920    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 609 aa  1238    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  49.26 
 
 		 624 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  50.25 
 
 		 619 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  51.01 
 
 		 617 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  48.85 
 
 		 619 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  48.5 
 
 		 618 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  51.03 
 
 		 640 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  48.68 
 
 		 626 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  46.43 
 
 		 617 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  47.66 
 
 		 626 aa  568  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  47.1 
 
 		 606 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  47.5 
 
 		 633 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  47.76 
 
 		 671 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  47.67 
 
 		 627 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  46.82 
 
 		 589 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  46.14 
 
 		 648 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  47.07 
 
 		 633 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  46.6 
 
 		 630 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  47.1 
 
 		 635 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  46.78 
 
 		 589 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  46.56 
 
 		 628 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  47.21 
 
 		 633 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  47.21 
 
 		 633 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  46.95 
 
 		 632 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  44.68 
 
 		 643 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  45.63 
 
 		 617 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  47.19 
 
 		 625 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  46.04 
 
 		 618 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  47.92 
 
 		 611 aa  514  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  46.04 
 
 		 618 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  42.46 
 
 		 618 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  43.87 
 
 		 618 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  45.38 
 
 		 631 aa  463  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  43.37 
 
 		 624 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  44.19 
 
 		 622 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  42.06 
 
 		 624 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  42.44 
 
 		 605 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  40.2 
 
 		 599 aa  439  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  42.44 
 
 		 624 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  41.16 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  42.43 
 
 		 620 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  40 
 
 		 619 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  37.85 
 
 		 629 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  37.29 
 
 		 631 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  37.34 
 
 		 627 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  37.14 
 
 		 626 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  37.42 
 
 		 603 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  45.42 
 
 		 279 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 560 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 649 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  23.31 
 
 		 587 aa  123  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  23.21 
 
 		 610 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  24.23 
 
 		 592 aa  120  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  24.92 
 
 		 612 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  25.63 
 
 		 617 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.05 
 
 		 590 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  24.51 
 
 		 607 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  25.17 
 
 		 592 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  24.67 
 
 		 606 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0835  feruloyl-CoA synthetase  43.75 
 
 		 312 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  23.61 
 
 		 604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  24.5 
 
 		 606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  28.29 
 
 		 510 aa  109  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  22.15 
 
 		 596 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  30.17 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  23.63 
 
 		 612 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  24.47 
 
 		 630 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 		 620 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  23.3 
 
 		 633 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  29.57 
 
 		 505 aa  104  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  22.73 
 
 		 598 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  23.87 
 
 		 622 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 607 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.12 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  23.52 
 
 		 607 aa  103  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  29.43 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  30.2 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  22.92 
 
 		 605 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  22.02 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  26.6 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  22.78 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  23.42 
 
 		 598 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  28.13 
 
 		 620 aa  102  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1468  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.38 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  22.69 
 
 		 555 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  27.19 
 
 		 503 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  23.11 
 
 		 606 aa  100  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.69 
 
 		 610 aa  100  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  22.52 
 
 		 598 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  27.41 
 
 		 510 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  27.7 
 
 		 508 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 508 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  24.06 
 
 		 600 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  23.93 
 
 		 509 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  28.2 
 
 		 501 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  23.63 
 
 		 602 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>