56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0835 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0835  feruloyl-CoA synthetase  100 
 
 		 312 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  98.51 
 
 		 618 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  98.51 
 
 		 618 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  70.11 
 
 		 628 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  72.09 
 
 		 630 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  70.35 
 
 		 632 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  67.8 
 
 		 633 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  70.93 
 
 		 635 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  67.8 
 
 		 633 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  59.16 
 
 		 671 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  57.95 
 
 		 640 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  52.53 
 
 		 633 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  53.33 
 
 		 624 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  48.04 
 
 		 633 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  44.62 
 
 		 627 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  44.62 
 
 		 648 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  50 
 
 		 589 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  45.7 
 
 		 626 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  43.75 
 
 		 609 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  43.84 
 
 		 630 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  50 
 
 		 626 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  46.67 
 
 		 589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  44.09 
 
 		 635 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  44.12 
 
 		 631 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  44.38 
 
 		 617 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  40.46 
 
 		 619 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  43.23 
 
 		 619 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  38.95 
 
 		 618 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  50.88 
 
 		 618 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  40.96 
 
 		 643 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  38.97 
 
 		 611 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  32.47 
 
 		 617 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  42.86 
 
 		 622 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 606 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  47.32 
 
 		 631 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  40.91 
 
 		 625 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 618 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  35.37 
 
 		 599 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  41.82 
 
 		 631 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  36.9 
 
 		 624 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  35.47 
 
 		 603 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  32.51 
 
 		 627 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  40.71 
 
 		 629 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  38.17 
 
 		 624 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  43.38 
 
 		 617 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  34.62 
 
 		 620 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  38.21 
 
 		 626 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  36.57 
 
 		 624 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  37.5 
 
 		 619 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  34.09 
 
 		 573 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  29.09 
 
 		 605 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 599 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 609 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  36.47 
 
 		 564 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 562 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.81 
 
 		 487 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>