More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4356 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 603 aa  1202    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  41.75 
 
 		 618 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  40.35 
 
 		 624 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  41.32 
 
 		 624 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  42.02 
 
 		 622 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  40.19 
 
 		 624 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  39.46 
 
 		 599 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  38.86 
 
 		 629 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  37.42 
 
 		 609 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  38.17 
 
 		 617 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  37.83 
 
 		 619 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  38.52 
 
 		 626 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  37.18 
 
 		 631 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  36.81 
 
 		 630 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  40.14 
 
 		 605 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  37.07 
 
 		 635 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  38.67 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  37.91 
 
 		 624 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  37.42 
 
 		 618 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  39.9 
 
 		 630 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  40.24 
 
 		 635 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  39.69 
 
 		 611 aa  363  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  37.54 
 
 		 620 aa  359  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  40.45 
 
 		 618 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  40.45 
 
 		 618 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  38.05 
 
 		 671 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  35.89 
 
 		 631 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  36.52 
 
 		 648 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  37.46 
 
 		 589 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  38.55 
 
 		 628 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  38.77 
 
 		 633 aa  353  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  38.77 
 
 		 633 aa  353  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  35.74 
 
 		 633 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  35.68 
 
 		 625 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  37.44 
 
 		 633 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  37.43 
 
 		 627 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  38.57 
 
 		 632 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 606 aa  346  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  34.09 
 
 		 617 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  37.18 
 
 		 626 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  37.54 
 
 		 589 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  38.24 
 
 		 640 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  36.39 
 
 		 627 aa  340  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  35.91 
 
 		 619 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  36.99 
 
 		 626 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  36.2 
 
 		 617 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  36.61 
 
 		 618 aa  326  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  35.21 
 
 		 643 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  36.33 
 
 		 619 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  36.33 
 
 		 573 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  40.7 
 
 		 279 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 560 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 612 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 		 592 aa  124  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0967  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.97 
 
 		 514 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 604 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  28.5 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 522 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  23.82 
 
 		 554 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  30.59 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  23.18 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  23.82 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 584 aa  108  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 508 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 520 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  23.48 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 517 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  21.88 
 
 		 551 aa  107  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  25.66 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  28.64 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  22.8 
 
 		 554 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  23.31 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3469  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.1 
 
 		 559 aa  106  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  26.29 
 
 		 607 aa  105  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 505 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 507 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 		 508 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  23.16 
 
 		 555 aa  104  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  27.4 
 
 		 526 aa  103  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  25.16 
 
 		 600 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.06 
 
 		 562 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  22.32 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  27.53 
 
 		 505 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  22.92 
 
 		 623 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.38 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  22.91 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  23.91 
 
 		 547 aa  102  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  22.24 
 
 		 592 aa  101  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  27.76 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 620 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  25.38 
 
 		 490 aa  100  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  22.85 
 
 		 554 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 518 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 583 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3407  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 526 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.108294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>