More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2363 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  59.76 
 
 		 589 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  64.26 
 
 		 624 aa  773    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  59.72 
 
 		 589 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  65.32 
 
 		 633 aa  828    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  58.35 
 
 		 633 aa  698    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  65.61 
 
 		 671 aa  793    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  60.99 
 
 		 626 aa  714    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 618 aa  1239    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  75.53 
 
 		 632 aa  886    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  68.11 
 
 		 640 aa  814    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  76.46 
 
 		 633 aa  893    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  58.75 
 
 		 648 aa  699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  75.94 
 
 		 628 aa  899    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  99.84 
 
 		 618 aa  1236    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  56.96 
 
 		 627 aa  687    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  76.35 
 
 		 630 aa  923    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  75.69 
 
 		 635 aa  916    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  76.46 
 
 		 633 aa  893    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  57.07 
 
 		 626 aa  663    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  51.55 
 
 		 617 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  50 
 
 		 619 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  49.4 
 
 		 618 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  47.83 
 
 		 606 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  99.28 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  50.26 
 
 		 619 aa  561  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  48.29 
 
 		 630 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  46.04 
 
 		 609 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  47.69 
 
 		 635 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  47.27 
 
 		 631 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  43.3 
 
 		 617 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  44.55 
 
 		 643 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  42.25 
 
 		 599 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  44.89 
 
 		 617 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  41.51 
 
 		 618 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  45 
 
 		 611 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  43.48 
 
 		 625 aa  458  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  43.94 
 
 		 624 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  42.1 
 
 		 619 aa  439  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  42.19 
 
 		 618 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  44.39 
 
 		 622 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  42.51 
 
 		 624 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  42.53 
 
 		 624 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  41.88 
 
 		 605 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  42.93 
 
 		 631 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  40.82 
 
 		 629 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0835  feruloyl-CoA synthetase  98.51 
 
 		 312 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  38.83 
 
 		 627 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  40.45 
 
 		 603 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  39.78 
 
 		 631 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  37.2 
 
 		 620 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  38.57 
 
 		 573 aa  364  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  39.2 
 
 		 626 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 560 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 		 630 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 606 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  27.79 
 
 		 606 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 606 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  28.2 
 
 		 607 aa  130  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  26.66 
 
 		 609 aa  124  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  26.66 
 
 		 609 aa  123  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  23.55 
 
 		 592 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 607 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  27.26 
 
 		 622 aa  120  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.39 
 
 		 590 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  22.82 
 
 		 592 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 616 aa  115  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 620 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 610 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  24.07 
 
 		 679 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 527 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  23.75 
 
 		 598 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 647 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  24.5 
 
 		 633 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  24.43 
 
 		 555 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  23.38 
 
 		 587 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 600 aa  107  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  24.92 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  22.84 
 
 		 592 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 		 633 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  26.11 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  22.93 
 
 		 598 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1468  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.07 
 
 		 563 aa  105  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  22.46 
 
 		 590 aa  104  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  22.71 
 
 		 597 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  24.3 
 
 		 610 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.94 
 
 		 562 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 903 aa  103  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 602 aa  102  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  25.66 
 
 		 616 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.38 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  23.31 
 
 		 612 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 		 1549 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  23.44 
 
 		 606 aa  100  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.35 
 
 		 601 aa  100  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 601 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  24.49 
 
 		 622 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 		 597 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  24.2 
 
 		 617 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7005  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 523 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  22.85 
 
 		 596 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>